From primer design to validation of results - is it possible by using free software only? / De la proiectarea primerilor la validarea rezultatelor - este posibil utilizând doar programe gratuite?

Abstract

Abstract Successful experiments in molecular biology require good knowledge about various methods and protocols. In molecular biology, nucleic acid manipulation is the essence, starting with the quality of extraction and ending with several analysis assays (PCR, RT-PCR, qPCR, PCR arrays, molecular cloning, etc). Though many of these are so called “standardized”, in practice there are many variables that can influence the outcome of the experiment. Due to the importance of optimal primer design in PCR assays, we will focus on primer designing and checking software, but we also present other useful free tools that can help researchers in the molecular biology field Rezumat Pentru a avea succes în experimentele de biologie moleculară, sunt necesare cunoștințe bune despre diversele metode și protocoale în acest domeniu. În biologia moleculară, manipularea corespunzătoare a acizilor nucleici este esențială, începând cu calitatea extracției până la testele efective (PCR, RT-PCR, qPCR, PCR array, clonare, etc). Deși multe dintre protocoale sunt “standardizate”, în practică sunt multe variabile care pot influența rezultatele experimentelor. Datorită importanței proiectării corecte a primerilor în metodele de tip PCR, ne vom concentra pe modul de proiectare și pe verificarea lor cu ajutorul programelor de calculator, dar de asemenea prezentăm și alte programe utile disponibile gratuit, care pot ajuta cercetătorii în domeniul biologiei moleculare