快速田间取样DNA条形码技术鉴定鸟类种子传播者

IF 1.4 4区 生物学 Q2 ORNITHOLOGY
J. P. González‐Varo, B. Rumeu, A. Traveset, J. Illera
{"title":"快速田间取样DNA条形码技术鉴定鸟类种子传播者","authors":"J. P. González‐Varo, B. Rumeu, A. Traveset, J. Illera","doi":"10.13157/arla.69.2.2022.sc2","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Summary. Avian seed dispersers are mostly identified by direct observations of fruit consumption or by analysis of seeds ejected by mist-netted birds. However, these methods typically require many fieldwork days to provide initial insight into which bird species disperse the seeds of a plant species or community of interest. Here, we highlight the advantages of DNA-barcoding analysis after rapid field sampling to uncover unknown seed dispersers. By rapid field sampling we refer to searching and sampling bird-dispersed seeds during a short period of time (just a few hours) in places where the probability of seed deposition is high. This ‘one-day’ sampling strategy relies on a major advantage of DNA barcoding: it allows identifying disperser species during a relatively long period after they defecate or regurgitate seeds, over a time frame of several weeks. We showcase this methodological approach with three emblematic and threatened plant species for which there is little or no information on avian seed dispersal, either from their entire range or in certain populations. The approach can be cost-effective and very valuable for pilot studies aimed at providing initial information on poorly known systems, or in locations where periodical fieldwork is not feasible owing to accessibility or logistic constraints.—González-Varo, J.P., Rumeu, B., Traveset, A. & Illera, J.C. (2022). Identifying avian seed dispersers through DNA barcoding after rapid field sampling. Ardeola, 69: 279-290. Resumen. Las aves dispersoras de semillas se identifican principalmente mediante observaciones de consumo de frutos o mediante capturas con redes de niebla para el análisis posterior de las semillas expulsadas. Sin embargo, estos métodos generalmente requieren muchos días de trabajo de campo para proporcionar una primera idea de qué especies de aves dispersan las semillas de una especie de planta o una comunidad vegetal de interés. Aquí, destacamos las ventajas del análisis de códigos de barras de ADN después de un muestreo de campo rápido para descubrir dispersores de semillas desconocidos. Con muestreo de campo rápido nos referimos a la búsqueda y muestreo de semillas dispersadas por aves durante un período corto de tiempo (de tan sólo unas horas) en lugares donde la probabilidad de deposición de semillas es alta. Esta estrategia de muestreo ‘en un único día’ se basa en una gran ventaja de los códigos de barras de ADN: permiten identificar especies dispersoras durante un período relativamente largo desde que estas defecan o regurgitan las semillas, cubriendo un marco temporal de varias semanas. Mostramos este enfoque metodológico con tres especies de plantas emblemáticas y amenazadas para las cuales hay poca o ninguna información sobre la dispersión de semillas por aves, ya sea para toda su área de distribución o en determinadas poblaciones. El enfoque puede ser rentable y muy valioso para estudios piloto destinados a proporcionar información inicial sobre sistemas poco conocidos, o en lugares donde el trabajo de campo periódico no es factible debido a limitaciones logísticas o de accesibilidad.—González-Varo, J.P., Rumeu, B., Traveset, A. e Illera, J.C. (2022). Identificación de aves dispersoras de semillas mediante muestreo de campo rápido y códigos de barras de ADN. 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摘要

总结。鸟类种子传播者大多是通过直接观察水果消耗或通过分析雾网鸟类喷射的种子来识别的。然而,这些方法通常需要许多天的实地工作,以初步了解哪种鸟类传播植物物种或感兴趣的群落的种子。在这里,我们强调了dna条形码分析在快速现场采样后发现未知种子散布者的优势。野外快速采样是指在种子沉降概率高的地方,在短时间内(仅几小时)对鸟类散布的种子进行搜索和采样。这种“一天”的采样策略依赖于DNA条形码的主要优势:它允许在它们排便或反刍种子后的相对较长时间内识别散布物种,大约需要几周的时间。我们以三种具有象征意义和受威胁的植物物种为例,展示了这种方法方法,无论是从它们的整个范围还是在某些种群中,鸟类种子传播的信息很少或根本没有。这种方法具有成本效益,对于旨在提供关于鲜为人知的系统的初步资料的试验性研究,或在由于可达性或后勤限制而无法进行定期实地工作的地点,是非常有价值的。-González-Varo, J.P, Rumeu, B., Traveset, A. & Illera, J.C.(2022)。野外快速取样DNA条形码技术鉴定鸟类种子传播者。农业科学,69:279-290。Resumen。半大猩猩的分散与分散是相同的原理,中间的观察与中间捕获的消耗与结果,与中间捕获的结果有关análisis半大猩猩的驱逐后。在禁运情况下,一般情况下需要大量的人力资源(días)、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源、人力资源和人力资源。Aquí, destacamos las ventajas del análisis de códigos de barras de ADN de desacamos与camestree de camo的联系rápido de descubrir与desconocidos的联系。1 .从学校的情况看:rápido没有参考资料,请查阅búsqueda .从学校的情况看,请查阅período .从学校的情况看,请查阅deposición .学校的情况,请查阅sólo .学校的情况。在此基础上,我们提出了一种新的策略,即允许相同的物种在不同的时间内扩散,并在不同的时间内扩散,如período。Mostramos este enfoque metodológico conres especies de plantas emblemáticas y amenazadas para las cuales hay poca o ninguna información sobre la dispersión de semillas por aves, ya sea para toda su área de distribución o en determinadas poblaciones。El enfoque puede可由许多有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的、有价值的。-González-Varo, J.P, Rumeu, B., Traveset, A. e . Illera, J.C.(2022)。Identificación de aves distrioras de semillas mediante muestreo de campo rápido y códigos de barras de ADN。农业科学,69:279-290。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Identifying Avian Seed Dispersers through DNA Barcoding After Rapid Field Sampling
Summary. Avian seed dispersers are mostly identified by direct observations of fruit consumption or by analysis of seeds ejected by mist-netted birds. However, these methods typically require many fieldwork days to provide initial insight into which bird species disperse the seeds of a plant species or community of interest. Here, we highlight the advantages of DNA-barcoding analysis after rapid field sampling to uncover unknown seed dispersers. By rapid field sampling we refer to searching and sampling bird-dispersed seeds during a short period of time (just a few hours) in places where the probability of seed deposition is high. This ‘one-day’ sampling strategy relies on a major advantage of DNA barcoding: it allows identifying disperser species during a relatively long period after they defecate or regurgitate seeds, over a time frame of several weeks. We showcase this methodological approach with three emblematic and threatened plant species for which there is little or no information on avian seed dispersal, either from their entire range or in certain populations. The approach can be cost-effective and very valuable for pilot studies aimed at providing initial information on poorly known systems, or in locations where periodical fieldwork is not feasible owing to accessibility or logistic constraints.—González-Varo, J.P., Rumeu, B., Traveset, A. & Illera, J.C. (2022). Identifying avian seed dispersers through DNA barcoding after rapid field sampling. Ardeola, 69: 279-290. Resumen. Las aves dispersoras de semillas se identifican principalmente mediante observaciones de consumo de frutos o mediante capturas con redes de niebla para el análisis posterior de las semillas expulsadas. Sin embargo, estos métodos generalmente requieren muchos días de trabajo de campo para proporcionar una primera idea de qué especies de aves dispersan las semillas de una especie de planta o una comunidad vegetal de interés. Aquí, destacamos las ventajas del análisis de códigos de barras de ADN después de un muestreo de campo rápido para descubrir dispersores de semillas desconocidos. Con muestreo de campo rápido nos referimos a la búsqueda y muestreo de semillas dispersadas por aves durante un período corto de tiempo (de tan sólo unas horas) en lugares donde la probabilidad de deposición de semillas es alta. Esta estrategia de muestreo ‘en un único día’ se basa en una gran ventaja de los códigos de barras de ADN: permiten identificar especies dispersoras durante un período relativamente largo desde que estas defecan o regurgitan las semillas, cubriendo un marco temporal de varias semanas. Mostramos este enfoque metodológico con tres especies de plantas emblemáticas y amenazadas para las cuales hay poca o ninguna información sobre la dispersión de semillas por aves, ya sea para toda su área de distribución o en determinadas poblaciones. El enfoque puede ser rentable y muy valioso para estudios piloto destinados a proporcionar información inicial sobre sistemas poco conocidos, o en lugares donde el trabajo de campo periódico no es factible debido a limitaciones logísticas o de accesibilidad.—González-Varo, J.P., Rumeu, B., Traveset, A. e Illera, J.C. (2022). Identificación de aves dispersoras de semillas mediante muestreo de campo rápido y códigos de barras de ADN. Ardeola, 69: 279-290.
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期刊介绍: Ardeola: International Journal of Ornithology is the scientific journal of SEO/BirdLife, the Spanish Ornithological Society. The journal had a regional focus when it was first published, in 1954. Since then, and particular during the past two decades, the journal has expanded its thematic and geographical scope. It is now a fully international forum for research on all aspects of ornithology. We thus welcome studies within the fields of basic biology, ecology, behaviour, conservation and biogeography, especially those arising from hypothesis-based research. Although we have a long publication history of Mediterranean and Neotropical studies, we accept papers on investigations worldwide. Each volume of Ardeola has two parts, published annually in January and July. The main body of each issue comprises full-length original articles (Papersand Review articles) and shorter notes on methodology or stimulating findings (Short Communications). The publication language is English, with summaries, figure legends and table captions also in Spanish. Ardeolaalso publishes critical Book Reviewsand PhD-Dissertation Summaries; summarising ornithological theses defended in Spain. Finally there are two Spanish-language sections, Ornithological News; summarising significant recent observations of birds in Spain, and Observations of Rare Birds in Spain, the annual reports of the Spanish Rarities Committee.
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