Hanifah Fuadi, P. Suryadarma, Khaswar Syamsu, S. Surono, Nurika Asih Setiyani, Selvia Mahilda Ridhoha, Aninda Zahra, Nadia Stepani, Muhammad Rasyid Ramadhan
{"title":"西爪哇苏邦地区司马都凤梨根产铁载体细菌的分离与筛选","authors":"Hanifah Fuadi, P. Suryadarma, Khaswar Syamsu, S. Surono, Nurika Asih Setiyani, Selvia Mahilda Ridhoha, Aninda Zahra, Nadia Stepani, Muhammad Rasyid Ramadhan","doi":"10.22302/iribb.jur.mp.v90i2.502","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Abstrak Bakteri mampu menghasilkan siderofor umtuk mengkelat besi dalam lingkungan dan digunakan oleh tanaman sebagai kofaktor dalam pembentukan klorofil untuk pembentukan glukosa. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri penghasil siderofor tinggi dari akar nanas Simadu, Kabupaten Subang Provinsi Jawa Barat. Bakteri diisolasi dari akar nanas Simadu, kemudian diseleksi dengan membedakan morfologinya dan diidentifikasi sebagai penghasil siderofor pada media Chrome Azurol S (CAS). Diperoleh 10 isolat bakteri (M1 sampai dengan M10) yang mampu menghasilkan siderofor. Isolat bakteri M7 memiliki kemampuan menghasilkan siderofor tertinggi. Isolat M7 teridentifikasi sebagai bakteri Gram negatif. Hasil analisis pohon filogenetik berdasarkan sekuensing 16S rDNA menunjukkan isolat kelompok genus Providencia. Dibandingkan dengan Providencia vermicola , isolat standar dari InaCC yang berasal dari akar Curcuma zedoaria, M7 menunjukkan produksi siderofor yang lebih tinggi pada media LB pada kondisi aerobik.[Kata kunci: Isolasi bakteri, Providencia, akumulasi siderofor, akar nanas Simadu Subang]Abstract Bacteria can produce siderophores for chelating iron in environments and are used by plants as an ingredient cofactor in building chlorophyll for glucose production. This study aims to obtain high siderophore-producing bacteria from the roots of pineapple Simadu, Subang District, West Java Province. Bacteria were isolated from Simadu pineapple roots, then selected by distinguishing their morphology and identified as producing siderophores with Chrome Azurol S (CAS) media. Obtained 10 bacterial isolates (M1 to M10) capable of producing siderophores. Bacterial isolate M7 had the highest siderophore production ability. M7 isolate was identified as Gram-negative bacteria. The results of the phylogenetic tree analysis based on 16S rDNA sequencing showed this isolate as the genus Providencia. Compared to the Providencia vermicola as reference isolate from InaCC derived from the roots of Curcuma zedoaria, M7 showed higher siderophore production in LB media under aerobic conditions.[Keywords: Bacteria isolation, Providencia, siderophore accumulation, Simadu Subang pineapple root]","PeriodicalId":11660,"journal":{"name":"E-Journal Menara Perkebunan","volume":"5 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-11-08","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Isolation and selection of siderophore-producing bacteria from roots of Simadu pineapple (Ananas comosus) in Subang District, West Java\",\"authors\":\"Hanifah Fuadi, P. Suryadarma, Khaswar Syamsu, S. Surono, Nurika Asih Setiyani, Selvia Mahilda Ridhoha, Aninda Zahra, Nadia Stepani, Muhammad Rasyid Ramadhan\",\"doi\":\"10.22302/iribb.jur.mp.v90i2.502\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Abstrak Bakteri mampu menghasilkan siderofor umtuk mengkelat besi dalam lingkungan dan digunakan oleh tanaman sebagai kofaktor dalam pembentukan klorofil untuk pembentukan glukosa. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri penghasil siderofor tinggi dari akar nanas Simadu, Kabupaten Subang Provinsi Jawa Barat. Bakteri diisolasi dari akar nanas Simadu, kemudian diseleksi dengan membedakan morfologinya dan diidentifikasi sebagai penghasil siderofor pada media Chrome Azurol S (CAS). Diperoleh 10 isolat bakteri (M1 sampai dengan M10) yang mampu menghasilkan siderofor. Isolat bakteri M7 memiliki kemampuan menghasilkan siderofor tertinggi. Isolat M7 teridentifikasi sebagai bakteri Gram negatif. Hasil analisis pohon filogenetik berdasarkan sekuensing 16S rDNA menunjukkan isolat kelompok genus Providencia. Dibandingkan dengan Providencia vermicola , isolat standar dari InaCC yang berasal dari akar Curcuma zedoaria, M7 menunjukkan produksi siderofor yang lebih tinggi pada media LB pada kondisi aerobik.[Kata kunci: Isolasi bakteri, Providencia, akumulasi siderofor, akar nanas Simadu Subang]Abstract Bacteria can produce siderophores for chelating iron in environments and are used by plants as an ingredient cofactor in building chlorophyll for glucose production. This study aims to obtain high siderophore-producing bacteria from the roots of pineapple Simadu, Subang District, West Java Province. Bacteria were isolated from Simadu pineapple roots, then selected by distinguishing their morphology and identified as producing siderophores with Chrome Azurol S (CAS) media. Obtained 10 bacterial isolates (M1 to M10) capable of producing siderophores. Bacterial isolate M7 had the highest siderophore production ability. M7 isolate was identified as Gram-negative bacteria. The results of the phylogenetic tree analysis based on 16S rDNA sequencing showed this isolate as the genus Providencia. Compared to the Providencia vermicola as reference isolate from InaCC derived from the roots of Curcuma zedoaria, M7 showed higher siderophore production in LB media under aerobic conditions.[Keywords: Bacteria isolation, Providencia, siderophore accumulation, Simadu Subang pineapple root]\",\"PeriodicalId\":11660,\"journal\":{\"name\":\"E-Journal Menara Perkebunan\",\"volume\":\"5 1\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2022-11-08\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"E-Journal Menara Perkebunan\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.22302/iribb.jur.mp.v90i2.502\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"E-Journal Menara Perkebunan","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.22302/iribb.jur.mp.v90i2.502","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
摘要
抽象的细菌可以在环境中产生根茎铁,并被植物用作组成葡萄糖的叶绿素的共同因素。这项研究的目标是获得一种从西爪哇省苏邦凤梨根产出的高传染性菌。从菠萝根中分离出来的细菌,然后通过对其形态的区分来选择,并确定为Chrome Azurol S (CAS)中红细胞生成器的产地。获得10种细菌分离物(M1至M10),可以产生响尾蛇素。M7细菌分离物具有产生最少量病原体的能力。一种M7异体被确定为阴性克细菌。根据16S序列rDNA对纤维遗传树的分析,发现了维罗维尼亚属中的异构体。与Providencia vermicola相比,来自zedoaria curacc的一种标准的非acc分离物,M7显示出在LB条件下的空气传播中,它的含量更高。[关键词:隔离细菌、供应物、菌丝沉积、菠萝根苏bang]这项研究旨在确定来自西爪哇省苏邦菠萝区sibang地区的高侧产细菌。细菌被从菠萝根中分离出来,然后被他们的形态和标识为美国生产带有铬Azurol S (CAS)对流的微生物。包含10个噬菌体异化(M1至M10)可生产响尾蛇毒液。噬菌体军情七处有最最具传染性的病原体生产能力。M7异化被认为是一种微负细菌。植物遗传学树分析的结果显示,这棵树与供养者属的异构体相同。参考维米科拉提供的证据,从无accola的起源中提取出来,M7在空气条件下的LB媒体上展示了更高的侧氧生产。[Keywords:隔离细菌,供养物,侧晕晕,菠萝根Simadu Subang]
Isolation and selection of siderophore-producing bacteria from roots of Simadu pineapple (Ananas comosus) in Subang District, West Java
Abstrak Bakteri mampu menghasilkan siderofor umtuk mengkelat besi dalam lingkungan dan digunakan oleh tanaman sebagai kofaktor dalam pembentukan klorofil untuk pembentukan glukosa. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri penghasil siderofor tinggi dari akar nanas Simadu, Kabupaten Subang Provinsi Jawa Barat. Bakteri diisolasi dari akar nanas Simadu, kemudian diseleksi dengan membedakan morfologinya dan diidentifikasi sebagai penghasil siderofor pada media Chrome Azurol S (CAS). Diperoleh 10 isolat bakteri (M1 sampai dengan M10) yang mampu menghasilkan siderofor. Isolat bakteri M7 memiliki kemampuan menghasilkan siderofor tertinggi. Isolat M7 teridentifikasi sebagai bakteri Gram negatif. Hasil analisis pohon filogenetik berdasarkan sekuensing 16S rDNA menunjukkan isolat kelompok genus Providencia. Dibandingkan dengan Providencia vermicola , isolat standar dari InaCC yang berasal dari akar Curcuma zedoaria, M7 menunjukkan produksi siderofor yang lebih tinggi pada media LB pada kondisi aerobik.[Kata kunci: Isolasi bakteri, Providencia, akumulasi siderofor, akar nanas Simadu Subang]Abstract Bacteria can produce siderophores for chelating iron in environments and are used by plants as an ingredient cofactor in building chlorophyll for glucose production. This study aims to obtain high siderophore-producing bacteria from the roots of pineapple Simadu, Subang District, West Java Province. Bacteria were isolated from Simadu pineapple roots, then selected by distinguishing their morphology and identified as producing siderophores with Chrome Azurol S (CAS) media. Obtained 10 bacterial isolates (M1 to M10) capable of producing siderophores. Bacterial isolate M7 had the highest siderophore production ability. M7 isolate was identified as Gram-negative bacteria. The results of the phylogenetic tree analysis based on 16S rDNA sequencing showed this isolate as the genus Providencia. Compared to the Providencia vermicola as reference isolate from InaCC derived from the roots of Curcuma zedoaria, M7 showed higher siderophore production in LB media under aerobic conditions.[Keywords: Bacteria isolation, Providencia, siderophore accumulation, Simadu Subang pineapple root]