A型流感病毒M2通道蛋白开闭机制: His37和Trp41间的氢键及阳离子-π作用的计算研究

程家高, 朱维良, 王岩丽, 闫秀花, 李忠, 唐赟, 蒋华良
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摘要

A型流感病毒的M2蛋白为一四聚的离子通道. 实验结果显示, 通道的通透性可能与His37间的氢键网络, 以及His37-Trp41间的阳离子-p作用网络有关. 以4-甲基咪唑间的氢键网络模拟通道His37间的氢键作用, 以质子化4-甲基咪唑和吲哚芳环体系来模拟His37和Trp41间的阳离子-p作用, 用量子化学MP2/6-311G**方法开展计算研究. 结果显示, 氢键网络中咪唑环间的每个N—H…N氢键作用强度可达-6.2 kcal·mol -1 ; 阳离子-Π作用网络中的每对阳离子-π作用最高可达-18.8 kcal·mol -1 (T-型作用构象)或-12.3 kcal·mol -1 (平行堆积型). 因此, 我们计算得到的作用能表明, 通过pH调控氢键作用和阳离子-π作用网络进而调控M2通道的通透性是可能的.
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
A型流感病毒M2通道蛋白开闭机制: His37和Trp41间的氢键及阳离子-π作用的计算研究
A型流感病毒的M2蛋白为一四聚的离子通道. 实验结果显示, 通道的通透性可能与His37间的氢键网络, 以及His37-Trp41间的阳离子-p作用网络有关. 以4-甲基咪唑间的氢键网络模拟通道His37间的氢键作用, 以质子化4-甲基咪唑和吲哚芳环体系来模拟His37和Trp41间的阳离子-p作用, 用量子化学MP2/6-311G**方法开展计算研究. 结果显示, 氢键网络中咪唑环间的每个N—H…N氢键作用强度可达-6.2 kcal·mol -1 ; 阳离子-Π作用网络中的每对阳离子-π作用最高可达-18.8 kcal·mol -1 (T-型作用构象)或-12.3 kcal·mol -1 (平行堆积型). 因此, 我们计算得到的作用能表明, 通过pH调控氢键作用和阳离子-π作用网络进而调控M2通道的通透性是可能的.
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