{"title":"物种鉴定方法比较:在DKI雅加达的ANGKE河口,斗鱼的形态和分子","authors":"A. Putri, Hawis H. Madduppa","doi":"10.21107/JK.V13I3.7303","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"ABSTRACT The Congaturi halfbeak (Hyporhampus limbatus), also known as the Valenciennes halfbeak, is an important economic fish in the fisheries sector of Indonesia, with a high level of diversity . The high diversity creates difficulties in the identification process for each species. The identification of species can be based on morphological and molecular methods. Therefore, this study aimed to compare the results of the morphological and molecular identification methods using a sample of H. limbatus. Morphological identification was carried out using morphometric techniques and for molecular identification following DNA Barcoding protocol. The results showed both morphological and molecular methods indicate that the sample was identified as Hyporhampus limbatus. The morphology of the Hyporhampus limbatus has an elongated body shape with a silvery color filled with scales all over his body except on the head. The lower jaw is taper in shape longer than the upper jaw and has an immarginate tail. While for the DNA Barcoding results show high similiraty (97%) and percentage of query coverage (98%) to identify Hyporhampus limbatus. Keyword : morphological, molecular, garfish ABSTRAK Ikan julung-julung (Hyporhampus limbatus) merupakan ikan ekonomis penting di sektor perikanan Indonesia yang memiliki tingkat keragaman yang tinggi. Tingginya keragaman menyebabkan kesulitan dalam proses identifikasi dari setiap spesies. M etode yang dapat digunakan untuk identifikasi spesies adalah metode morfologi dan molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan hasil dari metode identifikasi morfologi dan molekuler dengan menggunakan sampel ikan julung-julung. Identifikasi morfologi dilakukan menggunakan teknik morfometrik sedangkan untuk molekuler diaplikasikan dengan DNA Barcoding. Hasil identifikasi dengan metode morfologi dan molekuler menunjukkan hasil yang sama yaitu Hyporhampus limbatus. Berdasarkan hasil identifikasi morfologi Hyporhampus limbatus memiliki bentuk tubuh yang memanjang dengan warna perak dengan sisik di seluruh tubuhnya kecuali pada bagian kepala. Rahang bawahnya berbentuk lancip dengan ukuran lebih panjang dibandingkan dengan rahang atas serta memiliki ekor imarginate. H asil molekuler (DNA Barcoding) menunjukkan bahwa Hyporhampus limbatus memiliki nilai yang tinggi untuk tingkat kemiripan (97%) dan Query Cover (98%). Kata kunci : morfologi, molekuler, ikan julung-julung","PeriodicalId":17689,"journal":{"name":"Jurnal Kelautan: Indonesian Journal of Marine Science and Technology","volume":"41 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2020-12-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"PERBANDINGAN HASIL METODE IDENTIFIKASI SPESIES : MORFOLOGI DAN MOLEKULER PADA IKAN JULUNG-JULUNG DI TPI (TEMPAT PELELANGAN IKAN) MUARA ANGKE, DKI JAKARTA\",\"authors\":\"A. Putri, Hawis H. Madduppa\",\"doi\":\"10.21107/JK.V13I3.7303\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"ABSTRACT The Congaturi halfbeak (Hyporhampus limbatus), also known as the Valenciennes halfbeak, is an important economic fish in the fisheries sector of Indonesia, with a high level of diversity . The high diversity creates difficulties in the identification process for each species. The identification of species can be based on morphological and molecular methods. Therefore, this study aimed to compare the results of the morphological and molecular identification methods using a sample of H. limbatus. Morphological identification was carried out using morphometric techniques and for molecular identification following DNA Barcoding protocol. The results showed both morphological and molecular methods indicate that the sample was identified as Hyporhampus limbatus. The morphology of the Hyporhampus limbatus has an elongated body shape with a silvery color filled with scales all over his body except on the head. The lower jaw is taper in shape longer than the upper jaw and has an immarginate tail. While for the DNA Barcoding results show high similiraty (97%) and percentage of query coverage (98%) to identify Hyporhampus limbatus. Keyword : morphological, molecular, garfish ABSTRAK Ikan julung-julung (Hyporhampus limbatus) merupakan ikan ekonomis penting di sektor perikanan Indonesia yang memiliki tingkat keragaman yang tinggi. Tingginya keragaman menyebabkan kesulitan dalam proses identifikasi dari setiap spesies. M etode yang dapat digunakan untuk identifikasi spesies adalah metode morfologi dan molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan hasil dari metode identifikasi morfologi dan molekuler dengan menggunakan sampel ikan julung-julung. Identifikasi morfologi dilakukan menggunakan teknik morfometrik sedangkan untuk molekuler diaplikasikan dengan DNA Barcoding. Hasil identifikasi dengan metode morfologi dan molekuler menunjukkan hasil yang sama yaitu Hyporhampus limbatus. Berdasarkan hasil identifikasi morfologi Hyporhampus limbatus memiliki bentuk tubuh yang memanjang dengan warna perak dengan sisik di seluruh tubuhnya kecuali pada bagian kepala. Rahang bawahnya berbentuk lancip dengan ukuran lebih panjang dibandingkan dengan rahang atas serta memiliki ekor imarginate. H asil molekuler (DNA Barcoding) menunjukkan bahwa Hyporhampus limbatus memiliki nilai yang tinggi untuk tingkat kemiripan (97%) dan Query Cover (98%). Kata kunci : morfologi, molekuler, ikan julung-julung\",\"PeriodicalId\":17689,\"journal\":{\"name\":\"Jurnal Kelautan: Indonesian Journal of Marine Science and Technology\",\"volume\":\"41 1\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2020-12-25\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Jurnal Kelautan: Indonesian Journal of Marine Science and Technology\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.21107/JK.V13I3.7303\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Jurnal Kelautan: Indonesian Journal of Marine Science and Technology","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.21107/JK.V13I3.7303","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
摘要
conaturi half - beak (Hyporhampus limbatus),又称Valenciennes half - beak,是印度尼西亚渔业部门重要的经济鱼类,具有高度的多样性。高度的多样性给每个物种的鉴定过程带来了困难。物种的鉴定可以基于形态学和分子方法。因此,本研究的目的是比较一种缘木标本的形态学和分子鉴定方法的结果。形态学鉴定采用形态计量学技术进行,分子鉴定遵循DNA条形码协议。结果表明,形态和分子鉴定结果表明,该样品为边缘凹齿。边缘蛙的形态为细长的身体,呈银色,除头部外全身布满鳞片。下颚呈锥形,比上颚长,有一条边缘尾巴。而对于DNA条形码结果显示高相似度(97%)和查询覆盖率百分比(98%),以确定边缘凹。关键词:形态,分子,garfish (Hyporhampus limbatus), garfish, garfish, garfish, garfish, garfish, garfish, garfish, garfishTingginya keragaman menyebabkan kesulitan dalam报告了kasi dari设置物种的鉴定。[M . tode yang dapat digunakan untuk]用形态学和分子方法鉴定了一种植物。Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan hasil - dari方法鉴定了孟古那坎样品的形态和分子。鉴定卡西的形态,卡西的形态,卡西的形态,卡西的形态,卡西的形态,卡西的形态,卡西的形态,卡西的分子,卡西的分子,卡西的DNA条形码。哈西尔鉴定卡西登根方法形态学和分子结构。哈西尔杨氏体缘状下丘脑。[2] [1] [2] [1] [1] [1] [3] [1] [3] [1] [3] [1] [3] [1] [4] [1] [4]Rahang bawahnya berbentuk lancip dengan ukuran lebih panjang dibandingkan dengan Rahang是一种记忆和想象。H - il分子(DNA条形码)menunjukkan bahwa Hyporhampus limbatus memiliki nilai yang tinggi untuk tingkat kemiripan (97%) dan Query Cover(98%)。形态学,分子学,类型学
PERBANDINGAN HASIL METODE IDENTIFIKASI SPESIES : MORFOLOGI DAN MOLEKULER PADA IKAN JULUNG-JULUNG DI TPI (TEMPAT PELELANGAN IKAN) MUARA ANGKE, DKI JAKARTA
ABSTRACT The Congaturi halfbeak (Hyporhampus limbatus), also known as the Valenciennes halfbeak, is an important economic fish in the fisheries sector of Indonesia, with a high level of diversity . The high diversity creates difficulties in the identification process for each species. The identification of species can be based on morphological and molecular methods. Therefore, this study aimed to compare the results of the morphological and molecular identification methods using a sample of H. limbatus. Morphological identification was carried out using morphometric techniques and for molecular identification following DNA Barcoding protocol. The results showed both morphological and molecular methods indicate that the sample was identified as Hyporhampus limbatus. The morphology of the Hyporhampus limbatus has an elongated body shape with a silvery color filled with scales all over his body except on the head. The lower jaw is taper in shape longer than the upper jaw and has an immarginate tail. While for the DNA Barcoding results show high similiraty (97%) and percentage of query coverage (98%) to identify Hyporhampus limbatus. Keyword : morphological, molecular, garfish ABSTRAK Ikan julung-julung (Hyporhampus limbatus) merupakan ikan ekonomis penting di sektor perikanan Indonesia yang memiliki tingkat keragaman yang tinggi. Tingginya keragaman menyebabkan kesulitan dalam proses identifikasi dari setiap spesies. M etode yang dapat digunakan untuk identifikasi spesies adalah metode morfologi dan molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan hasil dari metode identifikasi morfologi dan molekuler dengan menggunakan sampel ikan julung-julung. Identifikasi morfologi dilakukan menggunakan teknik morfometrik sedangkan untuk molekuler diaplikasikan dengan DNA Barcoding. Hasil identifikasi dengan metode morfologi dan molekuler menunjukkan hasil yang sama yaitu Hyporhampus limbatus. Berdasarkan hasil identifikasi morfologi Hyporhampus limbatus memiliki bentuk tubuh yang memanjang dengan warna perak dengan sisik di seluruh tubuhnya kecuali pada bagian kepala. Rahang bawahnya berbentuk lancip dengan ukuran lebih panjang dibandingkan dengan rahang atas serta memiliki ekor imarginate. H asil molekuler (DNA Barcoding) menunjukkan bahwa Hyporhampus limbatus memiliki nilai yang tinggi untuk tingkat kemiripan (97%) dan Query Cover (98%). Kata kunci : morfologi, molekuler, ikan julung-julung