R. Arraiano-Castilho, A. C. Silva, C. Vila-Viçosa, Mário Rui da Costa Basílio e Castro, Luís Morgado, P. Oliveira
{"title":"欧洲的amitella枝(担子菌科:Amanitaceae):有争议的Amanita valens (e - j . gilbert) Bertault的澄清和分类群特异性PCR引物鉴定的重要性","authors":"R. Arraiano-Castilho, A. C. Silva, C. Vila-Viçosa, Mário Rui da Costa Basílio e Castro, Luís Morgado, P. Oliveira","doi":"10.5252/cryptogamie-mycologie2022v43a6","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"ABSTRACT The species in Amanita ser. Amidella (E.-J.Gilbert) Neville & Poumarat form a well-defined clade, but some taxa remain difficult to discriminate. In particular, the concept of Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault remains controversial. To understand the phylogenetic placement of a set of collections from southern Portugal with a novel nrDNA barcode, we have obtained nrDNA sequences for previously unassessed type collections. The taxon formerly described as A. curtipes f. pseudovalens Neville & Poumarat is interpreted as a separate species, A. pseudovalens comb. nov., stat. nov., and is genetically indistinct from those Portuguese collections, thus clarifying their taxonomic context. However, the morphology and ecology of our collections are distinct (respectively, ellipsoid to oblong basidiospores and occurrence on schist soils), and are proposed as a new variety, A. pseudovalens var. tartessiana var. nov. These developments also enable a better diagnosis of the taxa of series Amidella in Europe, a progress that is most decisive for the late winter to spring collections, and an identification key is proposed. Still, the co-occurrence and morphological similarity of the new variety with the prized edible A. ponderosa Malençon & R.Heim could leave some collections of either taxon unresolved. Thus, a molecular marker approach was developed, to provide a clear and cost-effective identification aid to complement the key. The proposed diagnostic tools can be applied toward a review of European Amidella taxa chorology from existing records, conserved materials, and future collections. RÉSUMÉ Le clade Amidella en Europe (Basidiomycota: Amanitaceae): clarification du controversé Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault et importance de l'utilisation de primers PCR spécifiques aux taxons pour l'identification. Les espèces de Amanita ser. Amidella (E.-J.Gilbert) Neville & Poumarat forment un clade bien défini, mais certains taxons restent difficiles à discriminer. En particulier, le concept d'Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault reste controversé. Pour comprendre le placement phylogénétique d'un ensemble de collections du sud du Portugal avec un nouveau barcode nrDNA, nous avons obtenu des séquences nrDNA pour des collections type non évaluées auparavant. Le taxon précédemment décrit comme A. curtipes f. pseudovalens Neville & Poumarat est interprété comme une espèce distincte, A. pseudovalens comb. nov., stat. nov., et est génétiquement indistinct de ces collections portugaises, clarifiant ainsi leur contexte taxonomique. Cependant, la morphologie et l'écologie de nos collections sont distinctes (respectivement, basidiospores ellipsoïdes à oblongues et occurrence sur des sols schisteux), et sont proposées comme une nouvelle variété, Amanita pseudovalens var. tartessiana var. nov. Ces développements permettent également de mieux diagnostiquer les taxons d'Amidella en Europe, progrès décisif pour les récoltes de la fin de l'hiver au printemps, et une clé d'identification est proposée. Malgré tout, la cooccurrence et la similitude morphologique de la nouvelle variété avec la très appréciée et comestible A. ponderosa Malençon & R.Heim pourrait laisser certaines collections non résolues. Ainsi, une approche de marqueurs moléculaires a été développée, afin de fournir une aide claire et économique à l'identification pour complémenter la clé. Les outils de diagnostic proposés peuvent être appliqués à une révision de la chorologie des taxons d'Amidella européens à partir des enregistrements existants, des matériaux conservés et des collections futures.","PeriodicalId":55201,"journal":{"name":"Cryptogamie Mycologie","volume":"6 1","pages":"139 - 157"},"PeriodicalIF":1.8000,"publicationDate":"2022-10-24","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"The Amidella Clade in Europe (Basidiomycota: Amanitaceae): Clarification of the Contentious Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault and the Importance of Taxon-Specific PCR Primers for Identification\",\"authors\":\"R. Arraiano-Castilho, A. C. Silva, C. Vila-Viçosa, Mário Rui da Costa Basílio e Castro, Luís Morgado, P. 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RÉSUMÉ Le clade Amidella en Europe (Basidiomycota: Amanitaceae): clarification du controversé Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault et importance de l'utilisation de primers PCR spécifiques aux taxons pour l'identification. Les espèces de Amanita ser. Amidella (E.-J.Gilbert) Neville & Poumarat forment un clade bien défini, mais certains taxons restent difficiles à discriminer. En particulier, le concept d'Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault reste controversé. Pour comprendre le placement phylogénétique d'un ensemble de collections du sud du Portugal avec un nouveau barcode nrDNA, nous avons obtenu des séquences nrDNA pour des collections type non évaluées auparavant. Le taxon précédemment décrit comme A. curtipes f. pseudovalens Neville & Poumarat est interprété comme une espèce distincte, A. pseudovalens comb. nov., stat. nov., et est génétiquement indistinct de ces collections portugaises, clarifiant ainsi leur contexte taxonomique. Cependant, la morphologie et l'écologie de nos collections sont distinctes (respectivement, basidiospores ellipsoïdes à oblongues et occurrence sur des sols schisteux), et sont proposées comme une nouvelle variété, Amanita pseudovalens var. tartessiana var. nov. Ces développements permettent également de mieux diagnostiquer les taxons d'Amidella en Europe, progrès décisif pour les récoltes de la fin de l'hiver au printemps, et une clé d'identification est proposée. Malgré tout, la cooccurrence et la similitude morphologique de la nouvelle variété avec la très appréciée et comestible A. ponderosa Malençon & R.Heim pourrait laisser certaines collections non résolues. Ainsi, une approche de marqueurs moléculaires a été développée, afin de fournir une aide claire et économique à l'identification pour complémenter la clé. 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摘要
【摘要】柽柳属植物属。内维尔和波马拉形成了一个定义明确的分支,但有些分类群仍然难以区分。特别是,野伞(e - j . gilbert) Bertault的概念仍然存在争议。为了了解一组来自葡萄牙南部的具有新型nrDNA条形码的藏品的系统发育位置,我们获得了以前未评估的类型藏品的nrDNA序列。以前被描述为a . curtipes f. pseudovalens Neville & Poumarat的分类群被解释为一个单独的种a . pseudovalens comb。11月11日,stat. nov.,从遗传学上看,与那些葡萄牙收藏没有区别,从而澄清了它们的分类背景。然而,我们收集的担子孢子的形态和生态是不同的(分别是椭球到长圆形的担子孢子和在片岩土壤上的分布),并提出了一个新的品种,a . pseudovalens var. tartessiana var. 11 .这些发展也使欧洲的Amidella系列分类群得到更好的诊断,这一进展对冬末到春季的收集最具决定性,并提出了鉴定关键。尽管如此,新品种与珍贵的可食用A. ponderosa malen& r.h heim的共存和形态相似性可能会使两个分类单元的一些收藏悬而未决。因此,我们开发了一种分子标记方法,以提供一种清晰而经济的识别辅助来补充关键。所提出的诊断工具可应用于现有记录、保存材料和未来收集的欧洲阿米德拉类群编年史的回顾。RÉSUMÉ欧洲的伞枝菌科(担子菌科:Amanitaceae):澄清有争议的Amanita valens (e - j . gilbert) Bertault et importance del 'utilisation de引物PCR sp cifiques aux taxons pour l'identification。Les espires de Amanita ser。内维尔和波玛拉特的人格在人格障碍中是不可避免的,因为某些税种在歧视他人方面存在困难。特别是,“amanita valens”(e - j . gilbert)的概念仍然存在争议。Pour comcomre le placement phylogj . samnastines d'un ensemble de collections du sud du du Portugal avec un nouveau barcode nrDNA, nous avons obtenu des samuquences nrDNA Pour des collections type non - samuastines auparavant。A. curtipes f. pseudovalens Neville & Poumarat est interpracimest comme une espuce distinct, A. pseudovalens comb。11月,stat. 11月,et est gsamnsamicement不明确的集合,葡萄牙语,澄清和模糊的上下文分类。Cependant拉morphologie et l 'ecologie德号集合是不同的(respectivement,担孢子椭球oblongues等发生在des溶胶schisteux),外星人是提出这样一个新式variete,鹅膏pseudovalens var. tartessiana var. 11月Ces发展可以合理de mieux diagnostiquer les分类单元d 'Amidella欧洲en,普洛古莱decisif倒les recoltes de la鳍de l冬之盟巴黎春天百货,等一个d 'identification est proposee。malgraise tout, la co发生和la similalmorphologique de la nouvelle variacimacest est avec la trvelle appracimacest est comcomable A. ponderosa malen & R.Heim pourrait laisser某些collection non - ransacsoles。例如,一种方法确定了所有的模数,例如,将所有的模数和所有的模数和所有的模数和所有的模数和所有的模数和所有的模数和所有的模数和所有的模数结合起来。as outils de diagnostic建议:应用程序- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
The Amidella Clade in Europe (Basidiomycota: Amanitaceae): Clarification of the Contentious Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault and the Importance of Taxon-Specific PCR Primers for Identification
ABSTRACT The species in Amanita ser. Amidella (E.-J.Gilbert) Neville & Poumarat form a well-defined clade, but some taxa remain difficult to discriminate. In particular, the concept of Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault remains controversial. To understand the phylogenetic placement of a set of collections from southern Portugal with a novel nrDNA barcode, we have obtained nrDNA sequences for previously unassessed type collections. The taxon formerly described as A. curtipes f. pseudovalens Neville & Poumarat is interpreted as a separate species, A. pseudovalens comb. nov., stat. nov., and is genetically indistinct from those Portuguese collections, thus clarifying their taxonomic context. However, the morphology and ecology of our collections are distinct (respectively, ellipsoid to oblong basidiospores and occurrence on schist soils), and are proposed as a new variety, A. pseudovalens var. tartessiana var. nov. These developments also enable a better diagnosis of the taxa of series Amidella in Europe, a progress that is most decisive for the late winter to spring collections, and an identification key is proposed. Still, the co-occurrence and morphological similarity of the new variety with the prized edible A. ponderosa Malençon & R.Heim could leave some collections of either taxon unresolved. Thus, a molecular marker approach was developed, to provide a clear and cost-effective identification aid to complement the key. The proposed diagnostic tools can be applied toward a review of European Amidella taxa chorology from existing records, conserved materials, and future collections. RÉSUMÉ Le clade Amidella en Europe (Basidiomycota: Amanitaceae): clarification du controversé Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault et importance de l'utilisation de primers PCR spécifiques aux taxons pour l'identification. Les espèces de Amanita ser. Amidella (E.-J.Gilbert) Neville & Poumarat forment un clade bien défini, mais certains taxons restent difficiles à discriminer. En particulier, le concept d'Amanita valens (E.-J.Gilbert) Bertault reste controversé. Pour comprendre le placement phylogénétique d'un ensemble de collections du sud du Portugal avec un nouveau barcode nrDNA, nous avons obtenu des séquences nrDNA pour des collections type non évaluées auparavant. Le taxon précédemment décrit comme A. curtipes f. pseudovalens Neville & Poumarat est interprété comme une espèce distincte, A. pseudovalens comb. nov., stat. nov., et est génétiquement indistinct de ces collections portugaises, clarifiant ainsi leur contexte taxonomique. Cependant, la morphologie et l'écologie de nos collections sont distinctes (respectivement, basidiospores ellipsoïdes à oblongues et occurrence sur des sols schisteux), et sont proposées comme une nouvelle variété, Amanita pseudovalens var. tartessiana var. nov. Ces développements permettent également de mieux diagnostiquer les taxons d'Amidella en Europe, progrès décisif pour les récoltes de la fin de l'hiver au printemps, et une clé d'identification est proposée. Malgré tout, la cooccurrence et la similitude morphologique de la nouvelle variété avec la très appréciée et comestible A. ponderosa Malençon & R.Heim pourrait laisser certaines collections non résolues. Ainsi, une approche de marqueurs moléculaires a été développée, afin de fournir une aide claire et économique à l'identification pour complémenter la clé. Les outils de diagnostic proposés peuvent être appliqués à une révision de la chorologie des taxons d'Amidella européens à partir des enregistrements existants, des matériaux conservés et des collections futures.
期刊介绍:
Cryptogamie is divided into three sections, each published as an individual publication: Cryptogamie, Bryologie, Cryptogamie, Algologie and Cryptogamie, Mycologie. Cryptogamie is a French journal of international scope publishing in several European languages. It accepts original papers and review articles on the systematics, biology and ecology of all cryptogams (algae; bryophytes; fungi and lichens, respectively).