标题北美西部棉科植物的分子分类学

IF 0.5 4区 环境科学与生态学 Q4 BIODIVERSITY CONSERVATION
M. Young, Rebecca L. Smith, K. Pilgrim, D. Isaak, K. McKelvey, Sharon Parkes, J. Egge, M. Schwartz
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Species delimitation methods, primarily relying on a conservative interpretation of the phylogenetic species concept, were broadly concordant and indicated that 43 candidate species were present. Some named taxa were unsupported, whereas others, if recognized, would violate the phylogenetic species concept. Specimen assignment was largely unambiguous and geographic distributions were consistent with phylogeographic patterns in other taxa. Our work establishes a benchmark for understanding the diversity of sculpin in western North America and suggests new species hypotheses both there and in eastern North America. Resumen. La taxonomía de los sculpins (Cottus, Cottidae) sigue siendo uno de los últimos grandes rompecabezas sin resolver en la sistemática de los peces de agua dulce de Norteamérica. Utilizamos métodos moleculares para identificar los taxones candidatos y su distribución en el oeste de Norteamérica. Recolectamos especímenes (n = 8272) a través de una campaña de divulgación entre biólogos del oeste de Estados Unidos y Canadá. A partir de esa colección, secuenciamos hasta 2 genes mitocondriales y 2 nucleares de un subconjunto (n = 4009) de especímenes, pertenecientes a la mayoría de las cuencas del oeste de Estados Unidos. Adicionalmente, añadimos secuencias de bases de datos de secuencias públicas y aplicamos una serie de métodos de delimitación de especies e identificación de especímenes para evaluar los patrones filogenéticos y espaciales de diversidad. Los métodos de delimitación de especies basados principalmente en una interpretación conservadora del concepto filogenético de especie, fueron ampliamente concordantes e indicaron la presencia de 43 especies candidatas. Algunos de los taxones nombrados no estaban respaldados, mientras que otros, de ser reconocidos, violarían el concepto filogenético de especie. La asignación de especímenes fue en gran medida inequívoca y las distribuciones geográficas fueron coherentes con los patrones filogeográficos de otros taxones. Nuestro trabajo establece un punto de referencia para entender la diversidad de peces Cottus en el oeste de Norteamérica y sugiere nuevas hipótesis de especies tanto allí como en el este de Norteamérica.","PeriodicalId":49364,"journal":{"name":"Western North American Naturalist","volume":"50 1","pages":"307 - 345"},"PeriodicalIF":0.5000,"publicationDate":"2022-06-10","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"7","resultStr":"{\"title\":\"A Molecular Taxonomy of Cottus in western North America\",\"authors\":\"M. Young, Rebecca L. Smith, K. Pilgrim, D. Isaak, K. McKelvey, Sharon Parkes, J. Egge, M. Schwartz\",\"doi\":\"10.3398/064.082.0208\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Abstract. 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摘要

摘要雕花鱼(Cottus, cotidae)的分类仍然是北美淡水鱼系统学中最后一个未解决的主要难题之一。我们使用分子方法鉴定候选分类群及其在北美西部的分布。我们通过与美国西部和加拿大的生物学家联系来收集标本(n = 8272)。从这些样本中,我们对来自美国西部大多数盆地的一个样本子集(n = 4009)进行了多达2个线粒体基因和2个核基因的测序,添加了来自公共序列数据库的序列,并应用了一系列物种划分和标本鉴定方法来评估多样性的系统发育和空间格局。物种划分方法主要依赖于对系统发育物种概念的保守解释,结果大致一致,表明存在43种候选物种。一些已命名的分类群是没有证据支持的,而另一些分类群,如果被确认,将违反系统发育物种的概念。标本分配在很大程度上是明确的,地理分布与其他分类群的系统地理模式一致。我们的工作为了解北美西部雕塑的多样性建立了一个基准,并提出了在那里和北美东部的新物种假设。Resumen。La taxonomía de los sculpins (Cottus, Cottidae), sigue siendo uno de los últimos grandes rompecabezas sinresolver en La sistemática de los peces de aguagudulce de north teamrica。我们metodos分子帕拉要洛杉矶分类单元candidatos y苏distribucion en el oeste de Norteamerica。Recolectamos especimenes (n = 8272) traves de una坎帕纳德divulgacion之间生物活力del oeste y de美国加拿大。一个partite de esa colección, secuenciamos有2个基因mitocondriales和2个细胞核de un subconjunto (n = 4009) de especímenes, pertenecientes和la mayoría de las cuencas del oeste de Estados Unidos。Adicionalmente, anadimos secuencias de基地德拿督de secuencias publica y aplicamos una联赛de metodos de delimitacion de especies e identificacion de especimenes对位evaluar洛杉矶赞助人filogeneticos y de diversidad espaciales。1 .关于 特定物种的遗传变异和遗传变异的遗传变异和遗传变异的遗传变异,关于43种候选物种的遗传变异和遗传变异的遗传变异。无组织分类系统,无组织分类系统,无组织分类系统,无组织分类系统,violarían无组织分类系统,无组织分类系统。La asignación de especímenes fueron en gran medida inequívoca y las distribuciones geográficas fueron coherentes conlos patrones filogeográficos de otros taxones。Nuestro trabajo建立unpunto de reference para endender la diversidad de peces cotus en oeste de north teamsamica .通过sugiere nuevas hipótesis de especies tanto allí como eneste de north teamsamica。
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A Molecular Taxonomy of Cottus in western North America
Abstract. The taxonomy of sculpins (Cottus, Cottidae) remains one of the last major unresolved puzzles in the systematics of North American freshwater fishes. We used molecular approaches to identify candidate taxa and their distribution across western North America. We crowd-sourced the collection of specimens (n = 8272) via outreach to biologists in the western United States and Canada. From that collection, we sequenced—at up to 2 mitochondrial and 2 nuclear genes—a subset (n = 4009) of specimens from most basins in the western United States, added sequences from public sequence databases, and applied an array of species delimitation and specimen identification methods to assess phylogenetic and spatial patterns of diversity. Species delimitation methods, primarily relying on a conservative interpretation of the phylogenetic species concept, were broadly concordant and indicated that 43 candidate species were present. Some named taxa were unsupported, whereas others, if recognized, would violate the phylogenetic species concept. Specimen assignment was largely unambiguous and geographic distributions were consistent with phylogeographic patterns in other taxa. Our work establishes a benchmark for understanding the diversity of sculpin in western North America and suggests new species hypotheses both there and in eastern North America. Resumen. La taxonomía de los sculpins (Cottus, Cottidae) sigue siendo uno de los últimos grandes rompecabezas sin resolver en la sistemática de los peces de agua dulce de Norteamérica. Utilizamos métodos moleculares para identificar los taxones candidatos y su distribución en el oeste de Norteamérica. Recolectamos especímenes (n = 8272) a través de una campaña de divulgación entre biólogos del oeste de Estados Unidos y Canadá. A partir de esa colección, secuenciamos hasta 2 genes mitocondriales y 2 nucleares de un subconjunto (n = 4009) de especímenes, pertenecientes a la mayoría de las cuencas del oeste de Estados Unidos. Adicionalmente, añadimos secuencias de bases de datos de secuencias públicas y aplicamos una serie de métodos de delimitación de especies e identificación de especímenes para evaluar los patrones filogenéticos y espaciales de diversidad. Los métodos de delimitación de especies basados principalmente en una interpretación conservadora del concepto filogenético de especie, fueron ampliamente concordantes e indicaron la presencia de 43 especies candidatas. Algunos de los taxones nombrados no estaban respaldados, mientras que otros, de ser reconocidos, violarían el concepto filogenético de especie. La asignación de especímenes fue en gran medida inequívoca y las distribuciones geográficas fueron coherentes con los patrones filogeográficos de otros taxones. Nuestro trabajo establece un punto de referencia para entender la diversidad de peces Cottus en el oeste de Norteamérica y sugiere nuevas hipótesis de especies tanto allí como en el este de Norteamérica.
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Western North American Naturalist
Western North American Naturalist 环境科学-生态学
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期刊介绍: The Western North American Naturalist places neither restriction nor preference on manuscripts within the disciplines of the biological sciences. Each issue treats diverse taxa from the perspectives of various disciplines (e.g., ecology, population dynamics, behavior, systematics, anatomy, and physiology).
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GB/T 7714-2015
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