E. Kıymet, T. Atik, Esra Işık, B. Akgun, N. Çetingül, T. Akalın, F. Ozkinay
{"title":"非典型畸胎样横纹肌瘤患者的人口学、临床、病理特征及HSNF5 (SMARCB1)/INI1基因突变的研究","authors":"E. Kıymet, T. Atik, Esra Işık, B. Akgun, N. Çetingül, T. Akalın, F. Ozkinay","doi":"10.5336/pediatr.2019-72772","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"139 ÖZET Amaç: Atipik teratoid/rabdoid tümör (AT/RT), çocukluk çağı santral sinir sistemi (SSS) tümörlerinden olan embriyonel tümörlerin nadir bir alt grubunu oluşturmaktadır. 22q11.2'de lokalize SMARCB1/INI1 geninde somatik dokularda oluşan değişikliklerin (delesyon, nokta mutasyonu, heterozigosite kaybı), AT/RT’lerin yaklaşık %75-98’inde bulunduğu gösterilmiştir. Ayrıca AT/RT’li hastaların 1/3’ünde SMARCB1/INI1 geninde germline mutasyonlar bildirilmiştir. Bu çalışmada, AT/RT tanısı alan hastalarda bu tümör ile ilişkili bir tümör supresör gen olan SMARCB1/INI1 mutasyonlarının araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada, 2010-2015 yılları arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesinde, AT/RT tanısı almış olguların demografik, klinik, patolojik özellikleri ve SMARCB1/INI1 mutasyonları değerlendirildi. Olguların hepsinin tümör dokusuna ait patoloji preparatlarından ve ulaşılabilen olguların periferik kanlarından DNA izole edilerek, SMARCB1/INI1 geni için tüm ekzonik bölgeler polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltıldı, jel elektroforezi ile kontrol edildikten sonra DNA dizi analizi gerçekleştirildi. Tespit edilen varyasyonların patojenitesi, Amerikan Tıbbi Genetik Koleji 2015 kriterlerine göre değerlendirildi. Bulgular: Çalışmaya alınan 10 hastanın 7’si SSS’nin AT/RT’si, 2’si yumuşak dokuda RT, biri renal RT tanılıydı. Hastaların %77’sinde tümör dokusunda immünohistokimyasal yöntemler ile SMARCB1/INI1 protein ekspresyonu kaybı saptandı ve bu hastaların ortanca sağkalım süresinin 5 ay (1-69 ay, SE: 9,29 ay) olduğu görüldü. Dört hastanın tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde, mutasyon saptandı ve bu hastaların ortanca sağkalım süresi 5,5 ay (1-15 ay, SE: 2,95 ay) olarak saptandı. SMARCB1/INI1 geninde mutasyon saptanmayan hastaların ortanca sağkalım süresi 10,5 ay (1-81 ay, SE: 14,6 ay) olarak saptandı. Sonuç: Tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde mutasyon saptanan hastaların ortanca sağkalım sürelerinin, mutasyon saptanmayanlara göre daha kısa olduğu gözlenmiştir. Önceki yayınlardan farklı olarak AT/RT tanılı hasta grubumuzda, hiçbir hastada SMARCB1/INI1 geninde germline mutasyon saptanmamıştır.","PeriodicalId":39104,"journal":{"name":"Turkiye Klinikleri Pediatri","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2020-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":"{\"title\":\"Investigation of Demographic, Clinical, Pathological Features and HSNF5 (SMARCB1)/INI1 Gene Mutations in Patients Diagnosed as Atypical Teratoid Rhabdoid Tumors\",\"authors\":\"E. Kıymet, T. Atik, Esra Işık, B. Akgun, N. Çetingül, T. Akalın, F. Ozkinay\",\"doi\":\"10.5336/pediatr.2019-72772\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"139 ÖZET Amaç: Atipik teratoid/rabdoid tümör (AT/RT), çocukluk çağı santral sinir sistemi (SSS) tümörlerinden olan embriyonel tümörlerin nadir bir alt grubunu oluşturmaktadır. 22q11.2'de lokalize SMARCB1/INI1 geninde somatik dokularda oluşan değişikliklerin (delesyon, nokta mutasyonu, heterozigosite kaybı), AT/RT’lerin yaklaşık %75-98’inde bulunduğu gösterilmiştir. Ayrıca AT/RT’li hastaların 1/3’ünde SMARCB1/INI1 geninde germline mutasyonlar bildirilmiştir. Bu çalışmada, AT/RT tanısı alan hastalarda bu tümör ile ilişkili bir tümör supresör gen olan SMARCB1/INI1 mutasyonlarının araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada, 2010-2015 yılları arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesinde, AT/RT tanısı almış olguların demografik, klinik, patolojik özellikleri ve SMARCB1/INI1 mutasyonları değerlendirildi. Olguların hepsinin tümör dokusuna ait patoloji preparatlarından ve ulaşılabilen olguların periferik kanlarından DNA izole edilerek, SMARCB1/INI1 geni için tüm ekzonik bölgeler polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltıldı, jel elektroforezi ile kontrol edildikten sonra DNA dizi analizi gerçekleştirildi. Tespit edilen varyasyonların patojenitesi, Amerikan Tıbbi Genetik Koleji 2015 kriterlerine göre değerlendirildi. Bulgular: Çalışmaya alınan 10 hastanın 7’si SSS’nin AT/RT’si, 2’si yumuşak dokuda RT, biri renal RT tanılıydı. Hastaların %77’sinde tümör dokusunda immünohistokimyasal yöntemler ile SMARCB1/INI1 protein ekspresyonu kaybı saptandı ve bu hastaların ortanca sağkalım süresinin 5 ay (1-69 ay, SE: 9,29 ay) olduğu görüldü. Dört hastanın tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde, mutasyon saptandı ve bu hastaların ortanca sağkalım süresi 5,5 ay (1-15 ay, SE: 2,95 ay) olarak saptandı. SMARCB1/INI1 geninde mutasyon saptanmayan hastaların ortanca sağkalım süresi 10,5 ay (1-81 ay, SE: 14,6 ay) olarak saptandı. Sonuç: Tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde mutasyon saptanan hastaların ortanca sağkalım sürelerinin, mutasyon saptanmayanlara göre daha kısa olduğu gözlenmiştir. Önceki yayınlardan farklı olarak AT/RT tanılı hasta grubumuzda, hiçbir hastada SMARCB1/INI1 geninde germline mutasyon saptanmamıştır.\",\"PeriodicalId\":39104,\"journal\":{\"name\":\"Turkiye Klinikleri Pediatri\",\"volume\":null,\"pages\":null},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2020-01-01\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"1\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Turkiye Klinikleri Pediatri\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.5336/pediatr.2019-72772\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"Q4\",\"JCRName\":\"Medicine\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Turkiye Klinikleri Pediatri","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.5336/pediatr.2019-72772","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"Medicine","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1
摘要
139ÖZET靶点:Atipic畸胎瘤/rabdoid肿瘤(AT/RT),儿童中枢神经系统(SSS)是胚胎肿瘤的一个罕见亚组。在22q11.2上,SMARCB1/INI1的位置在体细胞组织中显示出变化(缺失、点突变、异锌铁矾丢失),AT/RT约占75-98%。此外,AT/RT患者报告了SMARCB1/INI1 1/3的细菌突变。Buçalışmada,AT/RT tanısıalan hastalarda Bu tümör ile ilişkili bir tümör supresör gen olan SMARCB1/INI1 mutasyonlarının araştırılmasıamaçlanmı。要求和方法:在本研究中,爱琴海大学医学院对2010年至2015年间被鉴定为AT/RT的患者的人口学、临床和病理特征以及SMARCB1/INI1突变进行了评估。当所有这些事件都从病理学制剂和外周血中的可用物质中分离出来时,通过SMARCB1/INI1所有eczonic区域的聚合酶链式反应扩增DNA,并通过jel电泳进行控制,进行DNA序列分析。根据美国医学院2015年的标准,对已鉴定变异的病原体进行了评估。结果显示:10名患者中有7名为SSS的AT/RT,2名为软组织RT,1名为肾脏RT。在77%的患者中,在SMARCB1/INI1蛋白暴露中,伴有免疫血栓的免疫血栓已经消失,并且已经发现这些患者是5个月(1-69个月,SE:9.29个月)。Dört hastanın tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde,突变发生在5天(1-15天,SE:2.95天)或5天。在SMARCB1/INI1中,无突变的患者平均生存期为10.5个月(1-81个月,SE:14.6个月)。结果,在SMARCB1/INI1的肿瘤组织中,已经观察到突变障碍比那些不了解突变的人更短。与之前的流不同,在我们已知的AT/RT患者组中,在任何天才患者SMARCB1/INI1中都没有观察到细菌突变。
Investigation of Demographic, Clinical, Pathological Features and HSNF5 (SMARCB1)/INI1 Gene Mutations in Patients Diagnosed as Atypical Teratoid Rhabdoid Tumors
139 ÖZET Amaç: Atipik teratoid/rabdoid tümör (AT/RT), çocukluk çağı santral sinir sistemi (SSS) tümörlerinden olan embriyonel tümörlerin nadir bir alt grubunu oluşturmaktadır. 22q11.2'de lokalize SMARCB1/INI1 geninde somatik dokularda oluşan değişikliklerin (delesyon, nokta mutasyonu, heterozigosite kaybı), AT/RT’lerin yaklaşık %75-98’inde bulunduğu gösterilmiştir. Ayrıca AT/RT’li hastaların 1/3’ünde SMARCB1/INI1 geninde germline mutasyonlar bildirilmiştir. Bu çalışmada, AT/RT tanısı alan hastalarda bu tümör ile ilişkili bir tümör supresör gen olan SMARCB1/INI1 mutasyonlarının araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada, 2010-2015 yılları arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesinde, AT/RT tanısı almış olguların demografik, klinik, patolojik özellikleri ve SMARCB1/INI1 mutasyonları değerlendirildi. Olguların hepsinin tümör dokusuna ait patoloji preparatlarından ve ulaşılabilen olguların periferik kanlarından DNA izole edilerek, SMARCB1/INI1 geni için tüm ekzonik bölgeler polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltıldı, jel elektroforezi ile kontrol edildikten sonra DNA dizi analizi gerçekleştirildi. Tespit edilen varyasyonların patojenitesi, Amerikan Tıbbi Genetik Koleji 2015 kriterlerine göre değerlendirildi. Bulgular: Çalışmaya alınan 10 hastanın 7’si SSS’nin AT/RT’si, 2’si yumuşak dokuda RT, biri renal RT tanılıydı. Hastaların %77’sinde tümör dokusunda immünohistokimyasal yöntemler ile SMARCB1/INI1 protein ekspresyonu kaybı saptandı ve bu hastaların ortanca sağkalım süresinin 5 ay (1-69 ay, SE: 9,29 ay) olduğu görüldü. Dört hastanın tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde, mutasyon saptandı ve bu hastaların ortanca sağkalım süresi 5,5 ay (1-15 ay, SE: 2,95 ay) olarak saptandı. SMARCB1/INI1 geninde mutasyon saptanmayan hastaların ortanca sağkalım süresi 10,5 ay (1-81 ay, SE: 14,6 ay) olarak saptandı. Sonuç: Tümör dokusunda SMARCB1/INI1 geninde mutasyon saptanan hastaların ortanca sağkalım sürelerinin, mutasyon saptanmayanlara göre daha kısa olduğu gözlenmiştir. Önceki yayınlardan farklı olarak AT/RT tanılı hasta grubumuzda, hiçbir hastada SMARCB1/INI1 geninde germline mutasyon saptanmamıştır.