马铃薯疥疮链球菌新种的鉴定

A. Muniz, L. Vitor, S. Destéfano
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A caracterização morfológica demonstrou alta diversidade de coloração de esporos e de colônias das espécies avaliadas, assim como variação de crescimento em diferentes meios de cultivo. As características bioquímicas evidenciaram diferenças entre as linhagens avaliadas no estudo e as linhagens Tipo de Streptomyces associadas à doença. Os dados das avaliações fisiológicas (pH, salinidade e temperatura) permitiram classificá-las em padrões de tolerância. Todas as 15 linhagens se mostraram patogênicas em sementes de rabanete e discos de batata. As análises in silico de PCR-RFLP do gene atpD juntamente com as análises filogenéticas do gene 16S RNAr e MLSA revelaram a ocorrência de nove novas espécies de Streptomyces associadas à sarna da batata no Brasil. Dentre essas, duas linhagens do G6 tiveram seus genomas sequenciados e as avaliações de DDH e ANI confirmaram os dados da ocorrência de novas espécies. 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摘要

马铃薯疥疮是巴西马铃薯产区普遍存在的一种病害,是马铃薯种植的一个限制因素。这种病害影响马铃薯的品质,因为马铃薯块茎表面的病变降低了其商业价值或阻碍了其商业化。链球菌属的不同种类是造成这种疾病的原因,调查该国的致病性种类是实施管理措施的主要因素。本研究旨在通过形态学、生化、生理、致病性和分子等5个特征参数的多相方法,将15株马铃薯链霉菌分为3个遗传组(G6、G9和G16)。形态学特征表明,被评价物种的孢子和菌落颜色的高度多样性,以及在不同培养基上的生长差异。生化特征显示了研究中评估的菌株与与疾病相关的链霉菌类型菌株之间的差异。生理评估数据(pH值、盐度和温度)允许将它们分类为耐受性模式。15个菌株均对萝卜种子和马铃薯盘具有致病性。通过PCR-RFLP对atpD基因的硅分析,以及16S rrnar和MLSA基因的系统发育分析,发现巴西出现了9种与马铃薯疥螨相关的链霉菌。其中,对两个G6菌株的基因组进行了测序,DDH和ANI的评估证实了新物种的出现。它们被命名为hilarionis链霉菌(IBSBF 2807T)和hayashii链霉菌(IBSBF 2953T)。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Identificação de novas espécies de Streptomyces associadas à sarna da batata
A sarna da batata é uma doença de ocorrência generalizada nas regiões produtoras do Brasil, tornando-se um fator limitante no cultivo dessa cultura. Essa doença afeta a qualidade da batata devido às lesões na superfície do tubérculo, que diminuem seu valor comercial ou impedem a sua comercialização. Diferentes espécies do gênero Streptomyces são responsáveis por essa doença e o levantamento das espécies patogênicas presentes no país é um fator primordial para a realização de medidas de manejo. O presente estudo teve por objetivo caracterizar e identificar 15 linhagens de Streptomyces sp. associadas à sarna da batata divididas em três grupos genéticos (G6, G9 e G16) por meio de abordagem polifásica envolvendo cinco parâmetros de caracterização: morfológico, bioquímico, fisiológico, patogênico e molecular. A caracterização morfológica demonstrou alta diversidade de coloração de esporos e de colônias das espécies avaliadas, assim como variação de crescimento em diferentes meios de cultivo. As características bioquímicas evidenciaram diferenças entre as linhagens avaliadas no estudo e as linhagens Tipo de Streptomyces associadas à doença. Os dados das avaliações fisiológicas (pH, salinidade e temperatura) permitiram classificá-las em padrões de tolerância. Todas as 15 linhagens se mostraram patogênicas em sementes de rabanete e discos de batata. As análises in silico de PCR-RFLP do gene atpD juntamente com as análises filogenéticas do gene 16S RNAr e MLSA revelaram a ocorrência de nove novas espécies de Streptomyces associadas à sarna da batata no Brasil. Dentre essas, duas linhagens do G6 tiveram seus genomas sequenciados e as avaliações de DDH e ANI confirmaram os dados da ocorrência de novas espécies. Elas foram denominadas Streptomyces hilarionis (IBSBF 2807T) e Streptomyces hayashii (IBSBF 2953T ).
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