评估OSAC拟议标准2021-S-0006实际效用的实验室间研究:使用GenBank进行野生动物分类分配的标准

Khushi K. Patel, Melissa K.R. Scheible, Kelly A. Meiklejohn
{"title":"评估OSAC拟议标准2021-S-0006实际效用的实验室间研究:使用GenBank进行野生动物分类分配的标准","authors":"Khushi K. Patel, Melissa K.R. Scheible, Kelly A. Meiklejohn","doi":"10.1016/j.fsiae.2023.100067","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"","PeriodicalId":93435,"journal":{"name":"Forensic science international. Animals and environments","volume":"4 ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Interlaboratory study to assess the practical utility of OSAC proposed standard 2021-S-0006: Standard for the use of GenBank for taxonomic assignment of wildlife\",\"authors\":\"Khushi K. Patel, Melissa K.R. Scheible, Kelly A. Meiklejohn\",\"doi\":\"10.1016/j.fsiae.2023.100067\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"\",\"PeriodicalId\":93435,\"journal\":{\"name\":\"Forensic science international. Animals and environments\",\"volume\":\"4 \",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2023-01-01\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Forensic science international. Animals and environments\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666937423000057\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Forensic science international. Animals and environments","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666937423000057","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

野生动物法医实验室经常被要求确认作为证据提交的材料的分类身份。当基于形态学的分类分配不可能时,通常采用基于DNA的方法,从业者通常依赖于将未知证据序列与GenBank等公共序列数据库进行比较。为了解决GenBank在个案工作中的使用问题,法医学科学地区委员会组织(OSAC)野生动物法医生物学小组委员会制定了2021-S-0006《使用GenBank进行野生动物分类分配的标准》(目前是OSAC提议的标准)。进行了一项实验室间研究,以评估2021-S-0006的实际效用。产生了40种不同野生动物的分类信息线粒体基因座的桑格序列数据。招募了全球11个野生动物法医实验室,并将10个未知样本送往2021-S-0006进行分析。将每个实验室生成的分类分配进行比较,a)与真实身份进行比较以确定正确性,b)跨实验室进行比较以评估一致性。在2021-S-0006之后,向物种水平报告的实验室在98.3%的情况下是正确的,并且在实验室之间观察到100%的一致性。此外,实验室选择的解释GenBank登录的标准(2021-s-0006第4.3节)也进行了独立评估,因为它们构成了确定分类报告适当水平的支柱。84%的病例正确选择了标准,大多数病例的实验室报告达到了适当的分类水平。总的来说,这项实验室间研究表明,OSAC提出的标准2021-S-0006为在野生动物法医案例工作中使用GenBank进行分类分配提供了一个极好的框架。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Interlaboratory study to assess the practical utility of OSAC proposed standard 2021-S-0006: Standard for the use of GenBank for taxonomic assignment of wildlife
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
Forensic science international. Animals and environments
Forensic science international. Animals and environments Pollution, Law, Forensic Medicine, Veterinary Science and Veterinary Medicine (General)
CiteScore
2.00
自引率
0.00%
发文量
0
审稿时长
142 days
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信