在布宜诺斯艾利斯大都会区(BAMA)的废水中检测SARS-CoV-2作为早期预警

IF 0.2 Q4 WATER RESOURCES
A. Barrio, Verónica Borro, Marcelo Cicchino, A. Morón, Lorena Coronel, J. Vuolo, Paula Mayón, Ayelén Moroz, Paula Maisa, Sebastián Alcántara, M. Torras, M. Cervini, Martín Arzeno, C. Godoy, Diego Campillay, Nestor Filliel, A. Salas, Paula Salvio
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摘要

阿根廷水与卫生公司(AYSA)为阿根廷布宜诺斯艾利斯大都市区(AMBA)1450多万居民提供基本服务,包括生产饮用水和废水处理。针对世界卫生组织(世卫组织)宣布的新冠疫情,Aysa开发了一种方法来评估未经处理废水中SARS-CoV-2的病毒遗传载量。这种方法的目的是根据国际经验,利用基于废水的流行病学监测的潜力。为了监测废水收集系统代表部分的病毒载量,我们使用了一种适合浓缩样本的超离心技术。在此之后,进行RNA提取和RT-QPCR以量化SARS-CoV-2的ORF1AB基因。这项研究于2020年12月至2021年6月进行,以预测第二波疫情。通过分析四家大型污水处理厂的数据,我们确定了病毒基因组载量log10与一两周后报告的log10阳性病例之间的统计显著关联。根据所获得的结果,我们得出的结论是,下水道病毒水平可以很好地预测未来不久将被诊断的临床病例。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Detección de SARS-CoV-2 en aguas residuales como alerta temprana en el Área Metropolitana de la Ciudad de Buenos Aires (BAMA)
RESUMEN Agua y Saneamientos Argentinos S.A. (AySA) brinda servicios esenciales que abarcan la producción de agua potable y el tratamiento de aguas residuales para una población que supera los 14,5 millones de habitantes en el Área Metropolitana de Buenos Aires (AMBA), Argentina. En respuesta a la declaración de pandemia por COVID-19 por parte de la Organización Mundial de la Salud (OMS), AySA desarrolló una metodología para evaluar la carga genética viral del SARS-CoV-2 en aguas residuales sin tratar. Este enfoque tenía como objetivo aprovechar el potencial de la vigilancia epidemiológica basada en aguas residuales, basándose en experiencias internacionales. Para monitorear la carga viral en las secciones representativas del sistema de recolección de aguas residuales, empleamos una técnica de ultracentrifugación adaptada para concentrar muestras. Después de esto, se realizaron la extracción de ARN y RT-qPCR para cuantificar el gen Orf1ab del SARS-CoV-2. Este estudio se realizó de diciembre de 2020 a junio de 2021, para anticipar la segunda ola de la pandemia. Al analizar los datos de cuatro grandes plantas de tratamiento de aguas residuales, identificamos asociaciones estadísticamente significativas entre la carga genómica viral log10 y los casos positivos log10 informados una o dos semanas después. En base a los resultados obtenidos, concluimos que los niveles de virus del alcantarillado podrían ser un buen predictor de futuros casos clínicos a ser diagnosticados en un futuro inmediato.
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