用宏基因组学方法鉴定盐湖蓝藻,巴西里约热内卢

IF 0.1 Q4 AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY
Thiago Corrêa de Almeida, Rodrigo Jardim Monteiro Fonseca, P. G. Moura, Elvira Carvajal, Nelson Peixoto Kotowski-Filho, A. Sotero-Martins
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摘要

Lagoa Salgada是一个位于里约热内卢州北部的沿海高盐度水体,因存在叠层石而闻名。蓝藻是沿海高盐泻湖中这些结构的主要主要生产者。该研究的目的是通过宏基因组学鉴定拉戈阿-萨尔加达存在的蓝藻。从2019年6月采集的水样中获得的遗传物质通过霰弹枪法进行测序。使用MetaWrap管道1.3版分析宏基因组数据,以确定蓝藻和生物过程。聚球藻属的丰度更高,占已鉴定蓝藻的64.3%,其次是聚球藻(23.6%)、双孢子虫(2%)和卡氏藻(1.8%)。最丰富的物种是聚球藻RS9909(46.7%)、聚囊藻PCC 6714(16.4%)、聚球藻WH 8101(9.2%)和聚囊藻CACIAM 05(4.3%)。我们鉴定了33个与样本中存在的基因相关的生物过程。Lagoa Salgada在其尚未被探索的水生生态系统中呈现出广泛的蓝藻多样性,证明了保护和保存该泻湖环境的必要性。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Identificação de cianobactérias na Lagoa Salgada por abordagem metagenômica, Rio de Janeiro, Brasil
A Lagoa Salgada é um corpo aquático hipersalino costeiro localizado no norte do Estado do Rio de Janeiro e reconhecido pela presença de estromatólitos. As cianobactérias são os principais produtores primários dessas estruturas em lagoas hipersalinas costeiras. O objetivo do estudo foi identificar as cianobactérias presentes na Lagoa Salgada por meio da metagenômica. O material genético obtido de uma amostra de água coletada no mês de junho de 2019 foi submetido ao sequenciamento pelo método shotgun. Os dados metagenômicos foram analisados utilizando o pipeline MetaWrap versão 1.3 para identificação das cianobactérias e dos processos biológicos. O gênero Synechococcus apresentou maior abundância correspondendo por 64,3% das cianobactérias identificadas, seguidos por Synechocystis (23,6%), Geminocystis (2%) e Calothrix (1,8%). As espécies mais abundantes foram Synechococcus sp. RS9909 (46,7%), Synechocystis sp. PCC 6714 (16,4%), Synechococcus sp. WH 8101 (9,2%), Synechocystis sp. CACIAM 05 (4,3%). Foram identificados 33 processos biológicos associados aos genes presentes na amostra. A Lagoa Salgada apresenta uma ampla diversidade de cianobactérias em seu ecossistema aquático ainda pouco explorado, fundamentando a necessidade de proteção e preservação deste ambiente lagunar. 
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Acta Brasiliensis
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