MetaBarcoding:研究墨西哥鱼类营养生态学的有希望的工具

IF 0.8 4区 环境科学与生态学 Q4 BIODIVERSITY CONSERVATION
Víctor Julio Piñeros, Nancy Calderón-Cortés
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摘要

使用不同的方法研究了鱼类在水生生态系统营养动态中的作用,这些方法可以确定它们的饮食和营养位置(对胃和粪便含量的目视检查、稳定同位素、DNA测序)。随着DNA高效测序技术的进步,近年来,MetaBarcoding方法的使用有所增加,表明它比其他方法具有更高的精度和分类范围,并允许在更短的时间内同时分析更多的样本。在这篇综述中,描述了元代码方法的步骤,讨论了其优点和局限性,以及为解决这些局限性而提出的实验和分析替代方案。此外,还综合了应用于鱼类营养生态学分析的元条形码方法的知识状况,以了解该方法在墨西哥的范围和局限性。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Metabarcoding: una herramienta prometedora para el estudio de la ecología trófica de peces mexicanos
El papel de los peces en la dinámica trófica de los ecosistemas acuáticos se ha estudiado usando diferentes métodos que permiten determinar su dieta y posición trófica (inspección visual del contenido estomacal y heces, isótopos estables, secuenciación de ADN). Con los avances tecnológicos en la secuenciación de alto rendimiento del ADN, el uso del método de metabarcoding se ha incrementado en los últimos años, demostrando tener mayor precisión y alcance taxonómico que otros métodos, además de que permite el análisis simultáneo de un mayor número de muestras en un menor tiempo. En esta revisión, se describen los pasos del método de metabarcoding, discutiendo sus ventajas y limitaciones, así como las alternativas experimentales y analíticas propuestas para atender dichas limitaciones. Además, se presenta una síntesis del estado del conocimiento del método de metabarcoding aplicado al análisis de la ecología trófica de peces para entender los alcances y las limitaciones de este método en México.
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来源期刊
Revista Mexicana de Biodiversidad
Revista Mexicana de Biodiversidad 环境科学-生物多样性保护
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69
审稿时长
12-24 weeks
期刊介绍: Revista Mexicana de Biodiversidad appears in 4 issues per year and publishes the products of original scientific research regarding biodiversity of the Americas (systematics, biogeography, ecology and evolution), as well as its conservation and management. The journal ensures high standards with a system of external peer review, and is included in the list of excellence of journals of the National Council of Science and Technology (CONACyT, Mexico). It is currently included in ASFA, Biological Abstracts, Biological Sciences, Latindex Periódica, RedALyC, Web of Science (Thomson Reuters), SciELO, SCOPUS, and Zoological Records.
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GB/T 7714-2015
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