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Este artículo pretende explorar la arquitectura interna de Laudato si’ en busca de las raíces de los principios fundamentales de la ecología integral. En este trabajo, una vez estudiados y considerados los principios «todo está conectado» y el «todo es superior a la parte» como los fundamentos de la encíclica, se aborda la teología de la creación de corte trinitario y la filosofía de la biología de los sistemas abiertos que se consideran los lugares donde echan las raíces los principios citados. Ahora bien, esta investigación también saca a la luz el ángulo muerto de la ecología integral: el puesto del hombre en el cosmos y su derivada ética. Por último, se propone la distinción entre vida y sujeto de la vida como ayuda para superar el reduccionismo que se puede filtrar desde el paradigma sistémico a la ecología integral.