基于辣椒疫霉菌确定某些biber基因型SRAP和SSR指示的遗传差异

Derim Pub Date : 2019-12-10 DOI:10.16882/derim.2019.557877
M. Göçmen, K. Abak
{"title":"基于辣椒疫霉菌确定某些biber基因型SRAP和SSR指示的遗传差异","authors":"M. Göçmen, K. Abak","doi":"10.16882/derim.2019.557877","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Dunyada biber yetistiriciligini sinirlayan en onemli hastaliklardan birisi, kok bogazi yanikligidir. Bazi baska turlerde oldugu gibi Capsicum annuum L. turune ait farkli genotiplerde de etmene karsi dayaniklilik kaynaklari mevcuttur. Dayaniklilik duzeyi farkli biber genotiplerinin genetik iliskilerinin belirlenmesi, dayaniklilik ile ilgili gen/genlerin kultur cesitlerine aktarilmasi acisindan onemlidir. Bu calismada, P. capsici ’ye karsi dayaniklilik duzeyi ve orijini farkli 12 dayanikli ve 4 duyarli biber genotipin filogenetik iliskileri SRAP (Sequence Related Amplified Polymorphism) ve SSR (Simple SequenceRepeat) molekuler belirtecleriyle belirlenmistir. Bunun icin, 144 SRAP primer kombinasyonu ve 27 SSR primer cifti kullanilmistir. Otuz iki SRAP primeri herhangi bir PCR urunu vermemistir. Elli primer kombinasyonunda yalnizca monomorfik DNA banti olusurken 31 primer kombinasyonu polimorfizm saglamis toplam 254 DNA fragmenti elde edilmis, bunlarin, 99’u (%39) monomorfik, 155’i (%61) polimorfik DNAbandi olarak degerlendirilmistir. SRAP belirtecleri ile 16 biber genotipi birbirinden genetik olarak ayrilmistir. SSR primerinin 15’i monomorfik bant olusturmasina karsin 12 SSR primeri ile toplam 36 DNA bandi elde edilmis bunlarin 33'u (%93) polimorfik olmustur. SSR belirtec sistemi ile 16 biber genotipinin bazilari (PM-217 KM2-11, Perennial LS-279, PBC-178, Sera Demre, PBC 179 KMAE-12) birbirinden ayrilamamistir. SRAP ve SSR belirtec verileri birlikte degerlendirildiginde, genotiplerin genetik iliskisi, orijine gore kumelemesi daha bilgi verici olmustur. P. capsici ’ye karsi dayaniklilik genitoru olarak kullanilan CM 334'den, PM 702, Perennial, PM-217, Tayvan'da temin edilen PBC grubu (1364, 1365, 178, 179 ve 413) ile Kahramanmaras biber populasyonundan selekte edilen KM211genotipleri genetik olarak farkli gruplarda yer aldigi belirlenmistir.","PeriodicalId":30721,"journal":{"name":"Derim","volume":"36 1","pages":"124-134"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2019-12-10","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":"{\"title\":\"Phytophthora capsici'ye dayanıklı bazı biber genotiplerinin SRAP ve SSR belirteçlerle genetik farklılıklarının belirlenmesi\",\"authors\":\"M. Göçmen, K. Abak\",\"doi\":\"10.16882/derim.2019.557877\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Dunyada biber yetistiriciligini sinirlayan en onemli hastaliklardan birisi, kok bogazi yanikligidir. Bazi baska turlerde oldugu gibi Capsicum annuum L. turune ait farkli genotiplerde de etmene karsi dayaniklilik kaynaklari mevcuttur. Dayaniklilik duzeyi farkli biber genotiplerinin genetik iliskilerinin belirlenmesi, dayaniklilik ile ilgili gen/genlerin kultur cesitlerine aktarilmasi acisindan onemlidir. Bu calismada, P. capsici ’ye karsi dayaniklilik duzeyi ve orijini farkli 12 dayanikli ve 4 duyarli biber genotipin filogenetik iliskileri SRAP (Sequence Related Amplified Polymorphism) ve SSR (Simple SequenceRepeat) molekuler belirtecleriyle belirlenmistir. Bunun icin, 144 SRAP primer kombinasyonu ve 27 SSR primer cifti kullanilmistir. Otuz iki SRAP primeri herhangi bir PCR urunu vermemistir. Elli primer kombinasyonunda yalnizca monomorfik DNA banti olusurken 31 primer kombinasyonu polimorfizm saglamis toplam 254 DNA fragmenti elde edilmis, bunlarin, 99’u (%39) monomorfik, 155’i (%61) polimorfik DNAbandi olarak degerlendirilmistir. SRAP belirtecleri ile 16 biber genotipi birbirinden genetik olarak ayrilmistir. SSR primerinin 15’i monomorfik bant olusturmasina karsin 12 SSR primeri ile toplam 36 DNA bandi elde edilmis bunlarin 33'u (%93) polimorfik olmustur. SSR belirtec sistemi ile 16 biber genotipinin bazilari (PM-217 KM2-11, Perennial LS-279, PBC-178, Sera Demre, PBC 179 KMAE-12) birbirinden ayrilamamistir. SRAP ve SSR belirtec verileri birlikte degerlendirildiginde, genotiplerin genetik iliskisi, orijine gore kumelemesi daha bilgi verici olmustur. P. capsici ’ye karsi dayaniklilik genitoru olarak kullanilan CM 334'den, PM 702, Perennial, PM-217, Tayvan'da temin edilen PBC grubu (1364, 1365, 178, 179 ve 413) ile Kahramanmaras biber populasyonundan selekte edilen KM211genotipleri genetik olarak farkli gruplarda yer aldigi belirlenmistir.\",\"PeriodicalId\":30721,\"journal\":{\"name\":\"Derim\",\"volume\":\"36 1\",\"pages\":\"124-134\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2019-12-10\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"1\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Derim\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.16882/derim.2019.557877\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Derim","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.16882/derim.2019.557877","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1

摘要

世界上最令人兴奋的感染之一是气味难闻的博加津。与其他一些旅游一样,辣椒也比不同的基因型有更多的动态来源。不同biber基因型的诊断正是确定遗传关系,即将基因/基因传递给与dayaniclics相关的培养体。在calimada中,辣椒假单胞菌被定义为dayanilic duze,是12个dayanikli和4个duyarli biber基因型的丝源性iliskis SRAP(序列相关扩增多态性)和SSR(简单序列重复序列)分子的来源。布农霉素、144个SRAP引物和27个SSR引物。32个SRAP引物不提供任何PCR饲料。在Elli的引物组合中,当单态DNA为单态时,收集到31个多态性Sagamis引物组合和254个DNA片段,这些片段被降解为99(%39)个单态DNA,155(%61)个多态性DNA Abandi。SRAP标记从16个biber基因型中进行遗传分离。SSR引物总数为33个(%93)多态性物质,而单态抗体的SSR引物为12个。利用SSR标记系统的16个biber基因型(PM-217 KM2-11,多年生LS-279,PBC-178,Sera Demre,PBC 179 KMAE-12)的碱基没有分离。当SRAP和SSR指标一起降解时,基因型的遗传关系必须是更多关于起源向上积累的信息。在台湾,由PBC组(1364、1365、178、179和413)和在不同组中遗传选择的KM211基因型的海洛因吸食者群体代表的辣椒P.capcici已被鉴定为CM 334、PM 702、Perennial、PM-217的激进天才。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Phytophthora capsici'ye dayanıklı bazı biber genotiplerinin SRAP ve SSR belirteçlerle genetik farklılıklarının belirlenmesi
Dunyada biber yetistiriciligini sinirlayan en onemli hastaliklardan birisi, kok bogazi yanikligidir. Bazi baska turlerde oldugu gibi Capsicum annuum L. turune ait farkli genotiplerde de etmene karsi dayaniklilik kaynaklari mevcuttur. Dayaniklilik duzeyi farkli biber genotiplerinin genetik iliskilerinin belirlenmesi, dayaniklilik ile ilgili gen/genlerin kultur cesitlerine aktarilmasi acisindan onemlidir. Bu calismada, P. capsici ’ye karsi dayaniklilik duzeyi ve orijini farkli 12 dayanikli ve 4 duyarli biber genotipin filogenetik iliskileri SRAP (Sequence Related Amplified Polymorphism) ve SSR (Simple SequenceRepeat) molekuler belirtecleriyle belirlenmistir. Bunun icin, 144 SRAP primer kombinasyonu ve 27 SSR primer cifti kullanilmistir. Otuz iki SRAP primeri herhangi bir PCR urunu vermemistir. Elli primer kombinasyonunda yalnizca monomorfik DNA banti olusurken 31 primer kombinasyonu polimorfizm saglamis toplam 254 DNA fragmenti elde edilmis, bunlarin, 99’u (%39) monomorfik, 155’i (%61) polimorfik DNAbandi olarak degerlendirilmistir. SRAP belirtecleri ile 16 biber genotipi birbirinden genetik olarak ayrilmistir. SSR primerinin 15’i monomorfik bant olusturmasina karsin 12 SSR primeri ile toplam 36 DNA bandi elde edilmis bunlarin 33'u (%93) polimorfik olmustur. SSR belirtec sistemi ile 16 biber genotipinin bazilari (PM-217 KM2-11, Perennial LS-279, PBC-178, Sera Demre, PBC 179 KMAE-12) birbirinden ayrilamamistir. SRAP ve SSR belirtec verileri birlikte degerlendirildiginde, genotiplerin genetik iliskisi, orijine gore kumelemesi daha bilgi verici olmustur. P. capsici ’ye karsi dayaniklilik genitoru olarak kullanilan CM 334'den, PM 702, Perennial, PM-217, Tayvan'da temin edilen PBC grubu (1364, 1365, 178, 179 ve 413) ile Kahramanmaras biber populasyonundan selekte edilen KM211genotipleri genetik olarak farkli gruplarda yer aldigi belirlenmistir.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
审稿时长
24 weeks
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信