马铃薯Y病毒RT-PCR检测特异性引物的设计

IF 0.5 4区生物学 Q4 PLANT SCIENCES

Acta Biologica Colombiana Pub Date : 2019-09-01 DOI:10.15446/ABC.V24N3.76523

Andrea Sierra Mejía, Yuliana Marcela Gallo García, P. G. Gutiérrez Sánchez, Mauricio Alejandro Marín Montoya

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引用次数: 2

摘要

马铃薯Y病毒（PVY）是世界上限制马铃薯生产的病毒之一。这种病毒通过马铃薯块茎种子和不同种类的蚜虫传播。种植经病毒健康认证的块茎对于其管理至关重要，为此需要ELISA和RT-PCR等高度敏感的检测方法。对于后一种测试，需要有特定的引物来诊断无症状组织中的病毒。本研究报告了在常规和实时RT-PCR（RT-QPCR）中检测PVY的PVY_COL引物。这些引物是根据哥伦比亚报告的这种病毒在不同宿主上的序列以及世界上发现的不同变体设计的。这些引物的另一个特点是，它们与最近在哥伦比亚发现的另一种影响马铃薯作物的马铃薯病毒V（PVV）的基因组没有交叉反应。预计PVY_COL引物将用于支持马铃薯种子材料认证计划，并推进该病毒的流行病学和植物检疫管理研究。

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Diseño de cebadores específicos para la detección por RT-PCR del Potato Virus Y (PVY)

El Potato virus Y (PVY) es uno de los virus más limitantes para la producción de papa (Solanum tuberosum y S. phureja) en el mundo. Este virus es transmitido por tubérculo-semilla de papa y por diferentes especies de áfidos. Para su manejo es fundamental la siembra de tubérculos certificados por su sanidad viral, para lo que se requieren metodologías de detección altamente sensibles como ELISA y RT-PCR. Para éstas últimas pruebas, es necesario disponer de cebadores específicos que permitan el diagnóstico del virus en tejidos asintomáticos. En este estudio se reportan los cebadores PVY_Col para la detección del PVY en RT-PCR convencional y en tiempo real (RT-qPCR). Estos cebadores fueron diseñados con base en las secuencias de este virus que se han reportado en Colombia sobre diferentes hospedantes, así como de las diferentes variantes encontradas en el mundo. Una particularidad adicional de estos cebadores es que no presentan reacción cruzada con el genoma del Potato virus V (PVV), otro potyvirus que recientemente se ha encontrado afectando cultivos de papa en Colombia. Se espera que los cebadores PVY_Col sean utilizados para apoyar los programas de certificación de material de siembra de papa, así como para adelantar estudios epidemiológicos y de manejo fitosanitario de este virus.

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Acta Biologica Colombiana Agricultural and Biological Sciences-General Agricultural and Biological Sciences

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期刊介绍： The journal is published quarterly and divulges original and unpublished results of basic and applied research about biological subjects with special interest in Neotropical region. Manuscripts may be research articles, reviews, reflection articles or short notes. The Acta biol. Colomb Journal have a scientific and editorial board composed of expert researchers of in their areas of knowledge.