利用生物信息学工具研究补体5对移植预后的潜在影响。

IF 0.8 4区医学 Q4 UROLOGY & NEPHROLOGY

Iranian journal of kidney diseases Pub Date : 2025-02-25 DOI:10.5254/s1q4yy85

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摘要

移植后补体系统的激活可能导致同种异体移植排斥反应。本研究旨在利用生物信息学工具评估影响肾移植成功的因素与补体5 （C5）之间的潜在关系。方法：使用GenCards和Genemania提供属于C5基因的遗传功能信息，使用STRING、UCSC、KEGG基因组浏览器揭示与其他基因的相互作用和各种途径。MiRDB用于指定与C5基因相关的mirna。使用UniProt数据库通过蛋白-蛋白相互作用来确定表达C5基因的组织。结果：在进行的生物信息学分析中，在幼年肾脏中发现了高水平的C5基因表达。25个基因被发现与C5密切相关。共鉴定出54种靶向C5基因的mirna。研究发现，C5基因参与补体激活（FDR = 6.46e-22）、补体结合（FDR = 2.20e-06）、细胞溶解（FDR = 4.82e-14）、补体激活调节（FDR = 4.08e-24）、血管内皮生长因子生成的正调节（FDR = 0.0430）、巨噬细胞趋化调节（FDR = 0.0447）、免疫应答激活（FDR = 1.26e-13）、白细胞介导免疫（FDR = 1.41e-09）等生物过程。先天性免疫反应（FDR = 3.05e-09）、同种异体移植排斥反应（FDR = 2.40e-12）、氧化损伤反应（FDR = 0.00016）和补体级联开始触发（FDR = 0.0244）。结论：本研究获得的数据将用于指导未来移植领域的实验研究，这些数据将使医生了解移植后同种异体移植物的状态。

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Introduction: Activation of the complement system following transplantation may result in allograft reject

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期刊介绍： The Iranian Journal of Kidney Diseases (IJKD), a peer-reviewed journal in English, is the official publication of the Iranian Society of Nephrology. The aim of the IJKD is the worldwide reflection of the knowledge produced by the scientists and clinicians in nephrology. Published quarterly, the IJKD provides a new platform for advancement of the field. The journal’s objective is to serve as a focal point for debates and exchange of knowledge and experience among researchers in a global context. Original papers, case reports, and invited reviews on all aspects of the kidney diseases, hypertension, dialysis, and transplantation will be covered by the IJKD. Research on the basic science, clinical practice, and socio-economics of renal health are all welcomed by the editors of the journal.