通过元基因组分析确定麻疯树(Jatropha curcas L.)根瘤菌的特征

Paula Cristiane Machado, Paulo Henrique Marques De Andrade, Euclides Matheucci Junior, Marcelo Falsarella Carazzolle, Lucas Miguel de Carvalho, Anderson Ferreira Da Cunha, P. T. Lacava
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Essas bactérias são consideradas promissoras para as áreas agrícolas e industriais. Diversas pesquisam buscam conhecer a diversidade e a distribuição dessas comunidades microbianas bem como o seu potencial biotecnológico. Neste estudo objetivou-se caracterizar e comparar a diversidade da comunidade bacteriana de solo rizosférico de pinhão-manso provenientes de três tratamentos: não irrigada/sequeiro, irrigação por gotejamento e irrigação por pivô, mostrando a abundância relativa dos principais grupos bacterianos presentes nesses tratamentos. No amplo nível taxonômico, foi possível identificar nas amostras, sequências dos filos de Acidobacteria e Chloroflexi, 4 ordens (Acidimicrobiales, Chthoniobacterales, Gaiellales e Rhodospirillalese), 7 famílias (Solibacteraceae, Chitinophagaceae, Acidobacteriaceae, Tepidisphaeraceae, Nitrosomonadaceae, Gemmatimonadaceae e Xanthobacteraceae e 8 gêneros (Acidothermus, Bacillus, Bradyrhizobium, Bryobacter, Reyranella, Sphingomonas, Steroidobacter e Variibacter. Os resultados demonstram que não houve aumento significativo de diversidade em nenhum tratamento avaliado. No entanto, a riqueza de espécies foi aumentada nas áreas de gotejamento e pivô quando comparadas com a área não irrigada. Os grupos bacterianos que se diferenciaram significamente entre o tratamento irrigados por pivô e o tratamento sequeiro são o gênero Bryobacter e o Filo Chloroflexi. 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摘要

麻疯树(Jatropha curcas L.)是一种多年生灌木植物,属于大戟科,原产于中美洲,目前在世界各地自发生长。根圈是土壤和植物根系之间的接触区,是一个重要的微生物生态位。定殖于根圈的微生物群落的组成主要受植物种类和土壤特性的影响。在植物与微生物的相互作用中,会发现被根部分泌物吸引的细菌,其中一些被称为根瘤菌。这些细菌被认为在农业和工业领域大有可为。一些研究试图了解这些微生物群落的多样性和分布情况,以及它们的生物技术潜力。本研究的目的是描述和比较麻疯树根瘤土壤细菌群落的多样性,包括非灌溉、滴灌和枢轴灌溉三种处理方式,显示这些处理方式中主要细菌群的相对丰度。在广泛的分类水平上,可以鉴定出酸性细菌门(Acidobacteria)和叶绿体门(Chloroflexi)、4 个目(Acidimicrobiales、Chthoniobacterales、Gaiellales 和 Rhodospirillalese)、7 个科(Solibacteraceae、Chitinophagaceae、Acidimicrobiales、Gaiellales 和 Rhodospirillalese)的序列、7科(溶菌科、甲壳素菌科、酸性杆菌科、嗜酸菌科、硝化单胞菌科、革囊菌科和黄杆菌科)和 8 属(酸热菌属、芽孢杆菌属、根茎芽孢杆菌属、布氏杆菌属、雷氏菌属、鞘氨醇单胞菌属、甾体菌属和变异菌属)。结果表明,在所有评估处理中,多样性都没有显著增加。不过,与非灌溉区相比,滴灌区和枢轴区的物种丰富度有所增加。在枢轴灌溉处理与非灌溉处理之间存在显著差异的细菌群是白杆菌属和绿藻门。结果表明,滴灌处理与整个群体的距离最大,而枢轴灌溉区和雨水灌溉区则相差无几。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Caracterização de rizobactérias associadas ao pinhão-manso (Jatropha curcas L.) por análise metagenômica
O pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma planta arbustiva de ciclo perene, pertencente à família das Euforbiáceas, originária da América Central e atualmente vegeta espontaneamente em diversas regiões do planeta. A rizosfera é a zona de contato entre o solo e as raízes das plantas, sendo um importante nicho microbiológico. Esta composição das comunidades microbianas que colonizam a rizosfera é influenciada principalmente pelas espécies de plantas e características do solo. Na interação planta-microrganismo, são encontradas bactérias atraídas por secreções exsudados das raízes e algumas dessas são denominadas de rizobactérias. Essas bactérias são consideradas promissoras para as áreas agrícolas e industriais. Diversas pesquisam buscam conhecer a diversidade e a distribuição dessas comunidades microbianas bem como o seu potencial biotecnológico. Neste estudo objetivou-se caracterizar e comparar a diversidade da comunidade bacteriana de solo rizosférico de pinhão-manso provenientes de três tratamentos: não irrigada/sequeiro, irrigação por gotejamento e irrigação por pivô, mostrando a abundância relativa dos principais grupos bacterianos presentes nesses tratamentos. No amplo nível taxonômico, foi possível identificar nas amostras, sequências dos filos de Acidobacteria e Chloroflexi, 4 ordens (Acidimicrobiales, Chthoniobacterales, Gaiellales e Rhodospirillalese), 7 famílias (Solibacteraceae, Chitinophagaceae, Acidobacteriaceae, Tepidisphaeraceae, Nitrosomonadaceae, Gemmatimonadaceae e Xanthobacteraceae e 8 gêneros (Acidothermus, Bacillus, Bradyrhizobium, Bryobacter, Reyranella, Sphingomonas, Steroidobacter e Variibacter. Os resultados demonstram que não houve aumento significativo de diversidade em nenhum tratamento avaliado. No entanto, a riqueza de espécies foi aumentada nas áreas de gotejamento e pivô quando comparadas com a área não irrigada. Os grupos bacterianos que se diferenciaram significamente entre o tratamento irrigados por pivô e o tratamento sequeiro são o gênero Bryobacter e o Filo Chloroflexi. Os resultados mostraram que o tratamento irrigado por gotejamento é a mais distante de todo o grupo, enquanto que as áreas de pivô e sequeiro apresentaram similaridade entre si.  
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