用简单序列重复序列（SSR）分析辣椒属植物的遗传差异和种群结构

IF 0.6 4区农林科学 Q4 AGRONOMY

Bioagro Pub Date : 2024-01-04 DOI:10.51372/bioagro361.3

Yasmín Araceli Gálvez-Muñoz, María Esther Cea-Migenes, Régulo Ruíz Salazar, G. Castañón-Nájera, L. Latournerie-Moreno, M. Ramírez-Meraz

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摘要

在茄科植物中，辣椒属是世界上非常重要的蔬菜属，在墨西哥被广泛种植。这项工作的目的是了解 14 个辣椒属种群（6 个来自墨西哥塔巴斯科州，5 个来自塔毛利帕斯州，3 个来自古巴）的关系、多样性和遗传结构。四种寡核苷酸共鉴定出 202 个等位基因，其中 38 个具有多态性。寡核苷酸 HpmsCaSIG19 扩增出的等位基因数最多（65 个），Hpms1-274 扩增出的等位基因数最少（35 个），平均等位基因数为 50.5 个。用 F-固定指数估算了种群的遗传结构。区域间的多样性值（PhiRT）为 0.264，这意味着种群间的变异率为 73.6%。区域内亚群之间的多样性较高（PhiPR=0.412）。PhiPT（FST 类似值）=0.567，可解释为受测种群基因频率的高度分化。聚类分析将距离为 11 的 14 个种群分为 5 组。聚类 I 和聚类 III 各由四个种群组成，而聚类 II、聚类 IV 和聚类 V 每个聚类有两个种群。在这项分析中，古巴的 Cachucha（Cach）种群与哈瓦那人 x Amashito（RCHaAm）和加班佐人 x 哈瓦那人（RCGaHa）的回交品种没有亲缘关系，也与墨西哥塔巴斯科的哈瓦那人种群没有亲缘关系。

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Diferencias genéticas y estructura de poblaciones de Capsicum spp. con secuencias simples repetidas (SSRs)

Entre las Solanáceas, Capsicum spp. es un género de hortalizas muy importante a nivel mundial, y cultivada extensamente en México. El objetivo del trabajo fue conocer la relación, diversidad y estructura genética de 14 poblaciones de Capsicum spp. (seis del estado de Tabasco y cinco de Tamaulipas, México, y tres de Cuba). Los cuatro oligonucleótidos identificaron 202 alelos, 38 de ellos fueron polimórficos. El mayor número de alelos (65) los amplificó el oligo HpmsCaSIG19 y Hpms1-274 detectó el menor número de alelos (35), la media de alelos fue de 50,5. La estructura genética de las poblaciones se estimó con los índices de fijación F. El valor de la diversidad entre regiones (PhiRT) fue 0,264, lo que significa que las poblaciones presentaron 73,6% de variación entre ellas. Se encontró alta diversidad entre subpoblaciones dentro de regiones (PhiPR=0,412). El PhiPT (análogo del FST)=0,567, puede interpretarse como alta diferenciación en las frecuencias génicas de las poblaciones evaluadas. El análisis clúster clasificó a las 14 poblaciones a una distancia de 11 en cinco grupos. Los clústeres I y III fueron formados por cuatro poblaciones cada uno, mientras que dos poblaciones por cluster se observaron en el clúster II, IV y V. En este análisis, la población Cachucha (Cach) de Cuba no se relacionó con las retrocruzas Habanero x Amashito (RCHaAm) y Garbanzo x Habanero (RCGaHa), tampoco a la población Habanero de Tabasco, México.

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Bioagro Agricultural and Biological Sciences-General Agricultural and Biological Sciences

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期刊介绍： Bioagro es una revista científica del Decanato de Agronomía de la Universidad Centroccidental “Lisandro Alvarado” (UCLA). Su periodicidad es cuatrimestral y se publica en los meses de enero, mayo y septiembre. Cada trabajo es revisado por al menos dos especialistas en el área, externos a la revista, de cuya opinión depende la aceptación definitiva. Se utiliza sistema de arbitraje doble ciego. La revista va dirigida, fundamental pero no exclusivamente, a profesionales y técnicos del área agrícola. Su objetivo es publicar trabajos científicos originales e inéditos en ciencias agrícolas que enfoquen aspectos de agronomía, botánica y propagación de plantas, entomología y zoología, suelos, fitopatología y protección vegetal, ingeniería agrícola, genética y mejoramiento de plantas, ecología, procesamiento de productos agrícolas, biotecnología y sociales. También pueden ser publicados artículos cortos en los que se presenten descubrimientos científicos, desarrollos tecnológicos y resultados de diagnósticos integrales, en la modalidad de Notas Técnicas. En Venezuela, se encuentra en las bibliotecas de todas las universidades e institutos de educación superior que ofrecen carreras agronómicas, así como de los entes oficiales de investigación agropecuaria. En el exterior, la revista llega a universidades y/o institutos de investigación agrícolas de todos los países de América Latina así como Estados Unidos, Canadá y España.