打破OROPOUCHE病毒诊断的障碍:一种使用等温回路介导扩增的快速分子诊断方法

Diego Michel Fernandes da Silva, Lívia do Carmo Silva, Juliana Santana de Curcio, Flávia Barreto de Sousa, Carlos Eduardo Anunciação
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摘要

Oropouche病毒(OROV)的流行潜力表明,迫切需要新的诊断方法,以扩大检测范围并在更短的时间内提供结果。逆转录介导等温扩增(RT-LAMP)是一种特异性高、灵敏度高、检测速度快、成本低的分子技术,在分子诊断中得到了广泛的应用。因此,本研究的目的是发展和标准化检测OROV的比色技术RT-LAMP。RT-LAMP反应采用热启动灯配色2x主混合试剂盒进行,并通过pH指示剂苯酚红色的颜色变化进行视觉评价。试剂的最终浓度,以及优化温度和反应时间的测定。最大反应时间为25分钟,最佳温度为67°C。与RT-qPCR相比,该检测具有较高的敏感性,可在几分钟内检测到约一个病毒副本,对登革热、寨卡病毒、基孔肯雅病毒和马雅罗病毒等多种虫媒病毒具有100%的特异性。OROV病毒的RT-LAMP是一种新的诊断方法,对于帮助世界各地的医院和保健中心诊断这种经常与其他虫媒病毒混淆的病原体具有重要意义。此外,它还可以成为监测OROV流行病学的有用工具,提醒人们注意该病毒在该国流行爆发的可能风险,并有助于控制这一被忽视的病原体。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
QUEBRANDO AS BARREIRAS DO DIAGNÓSTICO DO VÍRUS OROPOUCHE: UM MÉTODO RÁPIDO DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR USANDO AMPLIFICAÇÃO ISOTÉRMICA MEDIADA POR LOOP
O potencial epidêmico do vírus Oropouche (OROV) demonstra a necessidade urgente de novos métodos de diagnóstico que possam ampliar os testes e fornecer resultados em menos tempo. A amplificação isotérmica mediada por transcrição reversa (RT-LAMP) é uma técnica molecular que possui alta especificidade, sensibilidade, rápida detecção e baixo custo, e está sendo amplamente utilizada no diagnóstico molecular. Portanto, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e padronizar a técnica colorimétrica RT-LAMP para detecção do OROV. Reações de RT-LAMP foram realizadas utilizando o kit WarmStart LAMP colorimétrico 2x Master Mix, e o resultado foi determinado por avaliação visual através da mudança de cor do indicador de pH fenol vermelho. A concentração final dos reagentes, assim como a determinação da temperatura e tempo de reação otimizados. Um tempo máximo de reação de 25 minutos e a temperatura ideal de 67°C foram estabelecidos. O teste demonstrou alta sensibilidade em comparação com a RT-qPCR, sendo capaz de detectar cerca de uma cópia do vírus em poucos minutos e uma especificidade de 100% contra diversas arbovírus como Dengue, Zika, Chikungunya e Mayaro. A RT-LAMP para o vírus OROV é um diagnóstico inédito e de grande importância para auxiliar hospitais e centros de saúde ao redor do mundo no diagnóstico desse patógeno, que muitas vezes é confundido com outras arboviroses. Além disso, poderia ser uma ferramenta útil para vigilância epidemiológica do OROV, alertando a população sobre os possíveis riscos de surtos endêmicos desse vírus no país e auxiliando no controle desse patógeno negligenciado.
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