ISSR分子标记的选择用于BACUPARI的遗传特征

IF 0.3 Q4 AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY
Nativa Pub Date : 2023-09-15 DOI:10.31413/nat.v11i3.15205
Giovana Cuchi, Mariéllen Schmith Wolf, Eliane Cristina Moreno de Pedri, Kelli Évelin Müller Zortéa, Anderson Ortiz Alves, Joari Costa de Arruda, Carolina Joana da Silva, Ana Aparecida Bandini Rossi
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Para isso, foi extraído o DNA total de 40 indivíduos de bacupari, dos quais foram selecionados dois, que apresentassem bandas bem definidas e sem arraste, para realizar testes de amplificação de primers ISSR via PCR. Ao todo, foram testados 31 primers, os quais foram classificados quanto sua qualidade de amplificação, utilizando os padrões bom, ruim e ausente. Dos 31 primers testados, 13 apresentaram bons resultados quanto à presença e qualidade das bandas, portanto, indicados para o uso em pesquisas que visem à caracterização molecular e avaliação da diversidade genética da espécie Garcinia brasiliensis. Palavras-chave: Garcinia brasiliensis; marcador molecular; Pantanal. Evaluation of ISSR markers for molecular studies of bacupari ABSTRACT: The species Garcinia brasiliensis has various scientifically proven applications in folk medicine, however, the lack of dissemination of these species characteristics is a current problem. Among the studies that can enhance this knowledge is genetic diversity, for which ISSR molecular markers application is recommended as it is reliable, rapid, and economical. Therefore, this study aimed to select and classify dominant molecular markers for G. brasiliensis research. For this, total DNA was extracted from 40 bacupari individuals. Two individuals were selected to perform ISSR primer amplification tests by PCR. 31 primers were tested, which classified their amplification quality as good, poor, or absent. Out of the 31 tested primers, 13 showed good results regarding the presence and band quality, therefore, they were indicated for research use, aiming molecular characterization and Garcinia brasiliensis genetic diversity evaluation. 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摘要

巴西藤黄(Garcinia brasiliensis)在民间医学中有许多已被科学证实的应用,但缺乏对这些物种特征的披露是当前的一个问题。利用这一知识的研究包括遗传多样性,因此,ISSR分子标记的使用被认为是可靠、快速和经济的。因此,本研究旨在为巴西G. brasiliensis的研究选择和分类优势分子标记。为此,我们提取了40个bacupari个体的总DNA,其中2个具有明确的无拖带,通过PCR进行ISSR引物扩增试验。共检测了31条引物,按扩增质量分为好、坏和缺失。在31条引物中,有13条引物在条带的存在和质量方面表现出良好的结果,因此适合用于旨在对巴西藤黄进行分子表征和遗传多样性评价的研究。关键词:巴西藤黄;分子标记;潘塔纳尔。评价ISSR标记的分子研究bacupari文摘:藤黄属植物的物种在民间医学技术研究有各种scientifically证明应用程序,然而,这些物种的传播特性的缺乏是当前问题。在可以增强这一知识的研究中,有遗传多样性,建议应用ISSR分子标记,因为它可靠、快速和经济。因此,本研究旨在为巴西G. brasiliensis的研究选择和分类优势分子标记。= =地理= =根据美国人口普查,这个县的总面积为,其中土地和(1.5%)水。选择2个个体进行ISSR首次扩增PCR检测。对31个引物进行了测试,将其放大质量分为好、差或无。在31条引物中,有13条引物在存在性和条带质量方面表现良好,因此被用于研究用途、靶向分子特征和遗传多样性评价。关键词:巴西藤黄;分子标记;潘塔纳尔。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
SELEÇÃO DE MARCADORES MOLECULARES ISSR PARA CARACTERIZAÇÃO GENÉTICA DE BACUPARI
A espécie Garcinia brasiliensis apresenta diversas aplicações na medicina popular comprovadas cientificamente, entretanto, a falta de divulgação sobre essas características da espécie é um problema atual. Dentre os estudos que podem alavancar esse conhecimento está o da diversidade genética, para isso, o uso de marcadores moleculares ISSR é indicado por serem confiáveis, rápidos e econômicos. Sendo assim, este trabalho teve como objetivo selecionar e classificar marcadores moleculares dominantes para estudos com a espécie G. brasiliensis. Para isso, foi extraído o DNA total de 40 indivíduos de bacupari, dos quais foram selecionados dois, que apresentassem bandas bem definidas e sem arraste, para realizar testes de amplificação de primers ISSR via PCR. Ao todo, foram testados 31 primers, os quais foram classificados quanto sua qualidade de amplificação, utilizando os padrões bom, ruim e ausente. Dos 31 primers testados, 13 apresentaram bons resultados quanto à presença e qualidade das bandas, portanto, indicados para o uso em pesquisas que visem à caracterização molecular e avaliação da diversidade genética da espécie Garcinia brasiliensis. Palavras-chave: Garcinia brasiliensis; marcador molecular; Pantanal. Evaluation of ISSR markers for molecular studies of bacupari ABSTRACT: The species Garcinia brasiliensis has various scientifically proven applications in folk medicine, however, the lack of dissemination of these species characteristics is a current problem. Among the studies that can enhance this knowledge is genetic diversity, for which ISSR molecular markers application is recommended as it is reliable, rapid, and economical. Therefore, this study aimed to select and classify dominant molecular markers for G. brasiliensis research. For this, total DNA was extracted from 40 bacupari individuals. Two individuals were selected to perform ISSR primer amplification tests by PCR. 31 primers were tested, which classified their amplification quality as good, poor, or absent. Out of the 31 tested primers, 13 showed good results regarding the presence and band quality, therefore, they were indicated for research use, aiming molecular characterization and Garcinia brasiliensis genetic diversity evaluation. Keywords: Garcinia brasiliensis; molecular marker; Pantanal.
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