建议在牛中进行亲子鉴定的微卫星面板:在芬兰艾尔郡和荷尔斯泰因-弗里斯种群中揭示的信息

P. Bredbacka, M. Koskinen
{"title":"建议在牛中进行亲子鉴定的微卫星面板:在芬兰艾尔郡和荷尔斯泰因-弗里斯种群中揭示的信息","authors":"P. Bredbacka, M. Koskinen","doi":"10.23986/AFSCI.5625","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Kansainvalisen elaingenetiikan jarjesto (ISAG) on ehdottanut mikrosatelliitti-DNA:han perustuvaa menetelmaa yleisesti kaytettavaksi nautojen polveutumisten varmistamisessa. Eri rotujen valilla esiintyvasta mikrosatelliittien polymorfian vaihtelusta johtuen ISAGin ehdottaman menetelman tehokkuus vaihtelee rodun mukaan. Taman tutkimuksen tarkoituksena oliselvittaa ehdotettujen vaihtoehtojen (11, 9 tai 6 lokusta) tehokkuus suomalaisten ayrshire- ja holstein-friisilaisrotujen vaarien isyyksien paljastajana. Tulokset osoittavat yhdeksan rutiinitestaukseen tarkoitetun mikrosatelliitin paljastavan vaarat isyydet ayrshirella 99,84 %:n ja holstein-friisilaisella 99,91 %:n varmuudella. Kahden lisatutkimuksiin tarkoitetun mikrosatelliitin lisays nostaa vastaavat arvot 99,94 %:iin ayrshirella ja 99,98 %:iin holstein-friisilaisella. Kuuden mikrosatelliitin muodostaman menetelman avulla voidaan vaarat isyydet paljastaa 98,25 %:n todennakoisyydella ayrshirella ja 99,32 %:n todennakoisyydella holstein-friisilaisella. Vaikka edella mainitut todennakoisyydet osoittavat, etta vaarat isyydet voidaan sulkea pois tehokkaasti, havaitsimme tietyissa yksittaisissa tapauksissa (esim. lokus SPS115) suhteellisen vahaista polymorfiaa. Jos vastaavia tuloksia saadaan jatkossa myos muilla roduilla, tulisi kyseisten lokusten mahdollista vaihtoa harkita. Ongelmat korostuvat esim. tilanteissa, joissa emasta ei ole saatavissa naytetta.","PeriodicalId":374908,"journal":{"name":"Agricultural and Food Science in Finland","volume":"79 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"1999-01-03","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"11","resultStr":"{\"title\":\"Microsatellite panels suggested for parentage testing in cattle: informativeness revealed in Finnish Ayrshire and Holstein-Friesian populations\",\"authors\":\"P. Bredbacka, M. Koskinen\",\"doi\":\"10.23986/AFSCI.5625\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Kansainvalisen elaingenetiikan jarjesto (ISAG) on ehdottanut mikrosatelliitti-DNA:han perustuvaa menetelmaa yleisesti kaytettavaksi nautojen polveutumisten varmistamisessa. Eri rotujen valilla esiintyvasta mikrosatelliittien polymorfian vaihtelusta johtuen ISAGin ehdottaman menetelman tehokkuus vaihtelee rodun mukaan. Taman tutkimuksen tarkoituksena oliselvittaa ehdotettujen vaihtoehtojen (11, 9 tai 6 lokusta) tehokkuus suomalaisten ayrshire- ja holstein-friisilaisrotujen vaarien isyyksien paljastajana. Tulokset osoittavat yhdeksan rutiinitestaukseen tarkoitetun mikrosatelliitin paljastavan vaarat isyydet ayrshirella 99,84 %:n ja holstein-friisilaisella 99,91 %:n varmuudella. Kahden lisatutkimuksiin tarkoitetun mikrosatelliitin lisays nostaa vastaavat arvot 99,94 %:iin ayrshirella ja 99,98 %:iin holstein-friisilaisella. Kuuden mikrosatelliitin muodostaman menetelman avulla voidaan vaarat isyydet paljastaa 98,25 %:n todennakoisyydella ayrshirella ja 99,32 %:n todennakoisyydella holstein-friisilaisella. Vaikka edella mainitut todennakoisyydet osoittavat, etta vaarat isyydet voidaan sulkea pois tehokkaasti, havaitsimme tietyissa yksittaisissa tapauksissa (esim. lokus SPS115) suhteellisen vahaista polymorfiaa. Jos vastaavia tuloksia saadaan jatkossa myos muilla roduilla, tulisi kyseisten lokusten mahdollista vaihtoa harkita. Ongelmat korostuvat esim. tilanteissa, joissa emasta ei ole saatavissa naytetta.\",\"PeriodicalId\":374908,\"journal\":{\"name\":\"Agricultural and Food Science in Finland\",\"volume\":\"79 1\",\"pages\":\"0\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"1999-01-03\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"11\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Agricultural and Food Science in Finland\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.23986/AFSCI.5625\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Agricultural and Food Science in Finland","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.23986/AFSCI.5625","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 11

摘要

国际动物遗传学协会(ISAG)提出了一种基于微卫星 DNA 的方法,可普遍用于验证牛的血统。由于不同品种间微卫星多态性的差异,ISAG 建议的方法在不同品种间的有效性也不尽相同。本研究的目的是调查拟议方案(11、9 或 6 个位点)在揭示芬兰艾尔夏和荷斯坦-弗里斯兰祖父牛种父系亲属关系方面的有效性。结果表明,九个常规微卫星能检测出艾尔夏和荷斯坦-弗里斯兰的亲子关系,可信度分别为 99.84 % 和 99.91 %。为进一步调查而增加两个微卫星后,艾尔郡和荷斯坦-弗里斯兰的相应值分别提高到 99.94% 和 99.98%。采用 6 个微卫星的方法,在艾尔郡和荷尔斯泰因-弗里斯兰分别以 98.25% 和 99.32% 的置信度检测出危害。尽管上述概率表明可以有效地排除风险同工酶,但我们还是在某些单例中观察到了相对较强的多态性(如位点 SPS115)。如果将来在其他品种中也得到类似的结果,则应考虑替换这些位点的可能性。例如,在没有母本样本的情况下,问题就会更加突出。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Microsatellite panels suggested for parentage testing in cattle: informativeness revealed in Finnish Ayrshire and Holstein-Friesian populations
Kansainvalisen elaingenetiikan jarjesto (ISAG) on ehdottanut mikrosatelliitti-DNA:han perustuvaa menetelmaa yleisesti kaytettavaksi nautojen polveutumisten varmistamisessa. Eri rotujen valilla esiintyvasta mikrosatelliittien polymorfian vaihtelusta johtuen ISAGin ehdottaman menetelman tehokkuus vaihtelee rodun mukaan. Taman tutkimuksen tarkoituksena oliselvittaa ehdotettujen vaihtoehtojen (11, 9 tai 6 lokusta) tehokkuus suomalaisten ayrshire- ja holstein-friisilaisrotujen vaarien isyyksien paljastajana. Tulokset osoittavat yhdeksan rutiinitestaukseen tarkoitetun mikrosatelliitin paljastavan vaarat isyydet ayrshirella 99,84 %:n ja holstein-friisilaisella 99,91 %:n varmuudella. Kahden lisatutkimuksiin tarkoitetun mikrosatelliitin lisays nostaa vastaavat arvot 99,94 %:iin ayrshirella ja 99,98 %:iin holstein-friisilaisella. Kuuden mikrosatelliitin muodostaman menetelman avulla voidaan vaarat isyydet paljastaa 98,25 %:n todennakoisyydella ayrshirella ja 99,32 %:n todennakoisyydella holstein-friisilaisella. Vaikka edella mainitut todennakoisyydet osoittavat, etta vaarat isyydet voidaan sulkea pois tehokkaasti, havaitsimme tietyissa yksittaisissa tapauksissa (esim. lokus SPS115) suhteellisen vahaista polymorfiaa. Jos vastaavia tuloksia saadaan jatkossa myos muilla roduilla, tulisi kyseisten lokusten mahdollista vaihtoa harkita. Ongelmat korostuvat esim. tilanteissa, joissa emasta ei ole saatavissa naytetta.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信