Comparação de Sequências Biológicas em Cluster de GPUs na Nuvem

Abstract

A comparação de sequências genômicas é um processo utilizado para encontrar alterações estruturais em genes ou proteínas de organismos vivos. Ela é simples, computacionalmente custosa e necessita de algoritmos que reduzam seu o tempo de processamento. Este trabalho avalia o custo monetário e tempo de execução da comparação de sequências genômicas em instâncias na nuvem com GPUs. Resultados experimentais mostram que comparar sequências maiores nos clusters é vantajoso.