Tejidos fijados en formalina, embebidos en parafina (FFPE) como herramienta útil para extracción de ácidos nucleicos del SARS-CoV-2 en presuntas muertes causadas por COVID-19

Arismendy Benítez, Estefani Sánchez Marte, Claudia Suero Guzmán, Alejandro Vallejo Degaudenzi, Robert Paulino-Ramírez
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Abstract

En la República Dominicana, los primeros casos confirmados de Síndrome Respiratorio Agudo Severo asociado al Coronavirus tipo 2 (SARS-CoV-2) se notificaron a principios de marzo de 2020, con un aumento fluctuante entre diferentes hotspots en el territorio, y más de 500 mil casos con una tasa de letalidad que ha rondado entre 1.25-0.77 %. Debido al impacto del turismo en la economía dominicana, los primeros casos reportados en el país fueron asociados a visitantes de origen europeo. El objetivo de este estudio fue la detección post mortem del SARS-CoV-2 mediante la reacción cuantitativa en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (qRT-PCR) en muestras de tejidos fijados con formalina e incluidos en parafina (FFPE) de muestras provenientes de casos sospechosos de la infección, y describir la relación con los hallazgos histopatológicos. Asimismo, evaluar el uso de qRT-PCR como herramienta para el diagnóstico post mortem de SARS-CoV-2 utilizando tejido FFPE, especialmente en aquellos casos en los que se desconoce la causa de muerte. Mediante un estudio retrospectivo realizado en un solo centro se seleccionaron dos casos que cumplían los criterios para el mismo. Los ácidos nucleicos se extrajeron de tejidos FFPE archivados seis meses después de las pautas internacionales de bioseguridad, por lo que se obtuvo ácido nucleico viral. El uso de tejidos FFPE podría ayudar a las autoridades de vigilancia epidemiológica a asignar un diagnóstico definitivo, principalmente en casos sospechosos de infecciones por SARS-CoV-2 y describir nuevos hallazgos histopatológicos de la enfermedad.
石蜡包埋福尔马林固定组织(FFPE)作为从SARS-CoV-2中提取核酸的有用工具
在多米尼加共和国,第一批与2型冠状病毒(SARS-CoV-2)相关的严重急性呼吸综合征(SARS-CoV-2)确诊病例于2020年3月初报告,该领土不同热点之间的波动增加,50多万例病例的死亡率约为1.25-0.77%。由于旅游业对多米尼加经济的影响,该国报告的第一批病例与来自欧洲的游客有关。这项研究的目的是通过定量逆转录聚合酶链反应(QRT-PCR)在福尔马林固定和石蜡包埋的组织样本中检测SARS-CoV-2,并描述与组织病理学发现的关系。此外,评估使用QRT-PCR作为使用FFPE组织进行SARS-CoV-2死后诊断的工具,特别是在死亡原因不明的情况下。通过在一个中心进行的回顾性研究,选择了两个符合该中心标准的病例。核酸是在国际生物安全准则实施六个月后从存档的FFPE组织中提取的,因此获得了病毒核酸。使用FFPE组织可以帮助流行病学监测当局进行最终诊断,主要是在疑似SARS-CoV-2感染的病例中,并描述该疾病的新组织病理学发现。
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