Acoplamiento molecular y modelado tridimensional por homología de flavonoides derivados de amentoflavona con las neuraminidasas H1N1 y H5N1 del virus de gripe aviar

Ricardo Vivas Reyes, Alejandro Morales, Johana Márquez Lázaro, Roger Varela, Leandro Herrera, Catalina Vivas Gómez
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Abstract

El virus de la influenza A es el responsable de la gripe aviar, condición patológica que afecta principalmente aves, caballos y mamíferos marinos, sin embargo, el subtipo H5N1 tiene la capacidad de infectar a los humanos de forma rápida, exponiéndolos a un posible evento pandémico. Por tanto, el objetivo de este estudio fue realizar el acoplamiento molecular y modelado tridimensional por homología de flavonoides derivados de amentoflavona con las neuraminidasas H1N1 y H5N1 del virus de gripe aviar. Inicialmente, se obtuvo por homología la estructura 3D de la neuraminidasa H1N1. Seguido, se realizó un acoplamiento molecular de H1N1 con seis ligandos (F36, Ginkgetin, 3S,3R, 5S,5R, 6S y 6R), y más adelante H5N1 y los ligandos F36, Ginkgetin, 5R y 6R. Finalmente, a los complejos obtenidos se les realizó un análisis de interacciones. Los resultados dejaron en evidencia una relación entre la actividad inhibitoria y las interacciones tipo puente de hidrógeno e hidrofóbicas formadas entre el sitio activo de las neuraminidasas y los ligandos. Además, se observó una mejora en la actividad inhibitoria de los ligandos para la estereoquímica tipo R y sustituyentes poco voluminosos. De ahí que se propongan la evaluación experimental de los ligandos 5R y 6R como potenciales inhibidores de H5N1.
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门冬黄酮衍生物类黄酮与禽流感病毒H1N1和H5N1神经氨酸酶的分子对接和三维同源性建模
甲型流感病毒是导致禽流感的原因,这是一种主要影响鸟类、马和海洋哺乳动物的疾病,但H5N1亚型有能力迅速感染人类,使人类面临可能的大流行事件。因此,本研究的目的是对甲型H1N1和H5N1神经氨酸酶衍生的黄酮类化合物进行分子偶联和三维同源建模。首先,通过同源获得H1N1神经氨酸酶的三维结构。随后,H1N1与6个配体(F36、Ginkgetin、3S、3R、5S、5R、6S、6R)和H5N1与F36、Ginkgetin、5R、6R)进行分子偶联。最后,对得到的配合物进行了相互作用分析。结果表明,抑制活性与神经氨酸酶活性位点与配体之间形成的疏水和氢桥式相互作用有关。此外,配体对R型立体化学和小取代基的抑制活性也有所提高。因此,提出了5R和6R配体作为H5N1潜在抑制剂的实验评价。
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