The future of polygenic risk scores in direct-to-consumer genomics

IF 29 1区 生物学 Q1 GENETICS & HEREDITY
Yuhao Sun, John Vines, Albert Tenesa
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直接面向消费者的基因组学中多基因风险评分的未来
2025年3月,直接面向消费者(DTC)的基因组公司23andMe申请了美国破产法第11章的破产保护。此前,对基因试剂盒的需求持续多年下降,加之2023年10月的数据泄露事件影响了近700万客户的声誉。尽管该公司随后宣布了重组计划,并在新的财务安排下继续运营,但破产程序引发了对超过1500万用户基因组档案长期处理的担忧,并促使美国众议院委员会就数据和国家安全影响举行了听证会(https://www.congress.gov/event/119th-congress/house-event/118362)。自2006年成立以来,23andMe通过基于唾液的祖先报告和扩展到健康相关预测的愿景建立了声誉。近年来,该公司推出了基于冠状动脉疾病(CAD)和2型糖尿病等疾病的多基因风险评分(PRS)模型的报告(https://permalinks.23andme.com/pdf/23_21-PRSMethodology_May2020.pdf).PRSs计算数千种遗传变异的加权总和,这些变异是来自全基因组关联研究(GWASs)的效应量,用于对疾病风险进行分层。许多研究已经证明了临床应用;例如,BOADICEA模型集成了313个变体PRS,以改善乳腺癌风险分层并指导预防。同样,校准良好的冠心病PRSs也被证明可以通过早期生活方式和药物干预来识别冠心病高危人群。然而,减贫战略的广泛执行情况仍然取决于关键的方法和人口因素。在GWASs中代表性不足的人群中,它们的预测准确性往往会降低,这引起了人们对当前prs可能加剧健康差异的担忧5。此外,较小的效应量和基因-环境相互作用进一步使从统计关联到有意义的个体风险估计的转换复杂化5。在临床环境中,可以通过专业指导解决围绕prs的歧义并将其置于情境中。相比之下,在DTC环境中,主要出于好奇心或对健康赋权的渴望,许多用户在没有足够的背景来衡量其优势和局限性的情况下接触PRS。一旦他们收到缺乏不确定性界限或专业解释的点估计,用户就无法理解其含义的细微差别。因此,我们要问,在没有临床支持的情况下,消费者在多大程度上能够负责任地驾驭这些复杂的概率得分?在本通信中,我们不质疑prs的科学基础或临床潜力,强调了DTC设置特有的挑战,并倡导提高透明度,情境化沟通和持续的消费者支持,以确保其负责任的使用。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
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来源期刊
Nature genetics
Nature genetics 生物-遗传学
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3 months
期刊介绍: Nature Genetics publishes the very highest quality research in genetics. It encompasses genetic and functional genomic studies on human and plant traits and on other model organisms. Current emphasis is on the genetic basis for common and complex diseases and on the functional mechanism, architecture and evolution of gene networks, studied by experimental perturbation. Integrative genetic topics comprise, but are not limited to: -Genes in the pathology of human disease -Molecular analysis of simple and complex genetic traits -Cancer genetics -Agricultural genomics -Developmental genetics -Regulatory variation in gene expression -Strategies and technologies for extracting function from genomic data -Pharmacological genomics -Genome evolution
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GB/T 7714-2015
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