Biocomputation using tristate buffers

IF 36.1 1区 生物学 Q1 BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
Lin Tang
{"title":"Biocomputation using tristate buffers","authors":"Lin Tang","doi":"10.1038/s41592-024-02423-2","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"","PeriodicalId":18981,"journal":{"name":"Nature Methods","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":36.1000,"publicationDate":"2024-09-10","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Nature Methods","FirstCategoryId":"99","ListUrlMain":"https://www.nature.com/articles/s41592-024-02423-2","RegionNum":1,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q1","JCRName":"BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
使用三态缓冲区进行生物计算
布尔逻辑门通常被认为是构建更复杂计算系统的基本要素。在哺乳动物细胞中应用这种方法进行生物计算时,一些生物学难题限制了构建多层网络时可实现的复杂程度。"西湖大学的谢明奇(音译)说:"我们一直在关注能否克服这一长期存在的障碍,扩大哺乳动物细胞的计算能力。谢明奇和同事邵嘉伟、朱凌云、王辉等人利用三态缓冲器开发出了一种新的生物计算策略。电子学中的三态缓冲器利用上游开关控制下游开关,下游输入只有在上游开关插入的状态下才能决定电路输出。按照类似的思路,在哺乳动物细胞中,研究人员利用两种小分子作为外部输入信号,控制由上游转录开关和下游翻译开关(由合成翻译启动因子介导)组成的基因回路。通过模块化工程原理,连接和扩展这些核心要素,就能构建出促进各种多通道输入输出计算的基因网络。这种所谓的 TriLoS(基于三态的逻辑合成)框架利用了其层次结构与生物调控网络中经常观察到的结构之间的相似性。它还得益于这样一个事实,即电子产品中的三态缓冲器通常有三种输出信号(0、1 和未插入的 Z),而生物系统只需要区分两种输出状态(ON 和 OFF),Xie 指出。"事实上,这种近似可能是实现稳健、资源高效和无干扰生物计算的关键因素"。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
Nature Methods
Nature Methods 生物-生化研究方法
CiteScore
58.70
自引率
1.70%
发文量
326
审稿时长
1 months
期刊介绍: Nature Methods is a monthly journal that focuses on publishing innovative methods and substantial enhancements to fundamental life sciences research techniques. Geared towards a diverse, interdisciplinary readership of researchers in academia and industry engaged in laboratory work, the journal offers new tools for research and emphasizes the immediate practical significance of the featured work. It publishes primary research papers and reviews recent technical and methodological advancements, with a particular interest in primary methods papers relevant to the biological and biomedical sciences. This includes methods rooted in chemistry with practical applications for studying biological problems.
文献相关原料
公司名称 产品信息 采购帮参考价格
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信