Investigation of Class 1, 2 and 3 Integrons in Klebsiella pneumoniae Isolates from Various Clinical Samples

ANKEM dergisi Pub Date : 2023-12-06 DOI:10.54962/ankemderg.1405451

Ahmet Çalişkan, Nilay Genç, S. Z. Öner, M. Demir, Hande Şenol, İ. Kaleli

{"title":"Investigation of Class 1, 2 and 3 Integrons in Klebsiella pneumoniae Isolates from Various Clinical Samples","authors":"Ahmet Çalişkan, Nilay Genç, S. Z. Öner, M. Demir, Hande Şenol, İ. Kaleli","doi":"10.54962/ankemderg.1405451","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"İntegronlar/gen kasetleri, yatay genetik alışverişi kolaylaştırmada önemli yere sahiptirler. Aynı zamanda direnç genlerinin edinilmesine ve yayılmasına yol açarlar. Bu çalışmada K. pneumoniae izolatlarında antibiyotik direnç oranları ve sınıf 1, 2 ve 3 integronların tespiti amaçlanmıştır. Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na Nisan 2023-Temmuz 2023 tarihleri arasında gönderilen farklı klinik örneklerden izole edilmiş 100 Klebsiella pneumoniae izolatı değerlendirmeye alındı. Bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik duyarlılık testleri, Phoenix™ (Becton Dickinson Diagnostics, ABD) otomatize sistemi ile yapıldı. DNA ekstraksiyonunda kaynatma yöntemi kullanıldı. Sınıf 1, 2 ve 3 integrona özgül polimeraz zincir reaksiyonu yapıldı. İzolatların antibiyotik direnç oranları ve sınıf 1, 2 ve 3 integron pozitifliği değerlendirildi. İzolatların 33’ünde (%33) sınıf 1 integron pozitifliği belirlendi. Bir izolatta sınıf 1 ve sınıf 2 integron pozitifliği birlikte tespit edilirken, sınıf 3 integron pozitifliği saptanmadı. İntegron pozitif izolatlar integron negatif izolatlarla karşılaştırıldığında; trimetoprim/sülfametoksazol (p=0.0001), siprofloksasin (p=0.0001), levofloksasin (p=0.01), seftriakson (p=0.05), sefuroksim (p=0.032) ve gentamisin (p=0.006) direnç oranlarında anlamlı direnç yüksekliği saptanmıştır. Ülkemizde integronlar ve ilgili direnç genlerinin araştırıldığı, klinik izolatlarda görülen çoklu antibiyotik direnç mekanizmalarının, antibiyotik direnci ile integron genlerinin ilişkisinin incelendiği kapsamlı çalışmalara ihtiyaç vardır.","PeriodicalId":479580,"journal":{"name":"ANKEM dergisi","volume":"23 8","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-12-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"ANKEM dergisi","FirstCategoryId":"0","ListUrlMain":"https://doi.org/10.54962/ankemderg.1405451","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

İntegronlar/gen kasetleri, yatay genetik alışverişi kolaylaştırmada önemli yere sahiptirler. Aynı zamanda direnç genlerinin edinilmesine ve yayılmasına yol açarlar. Bu çalışmada K. pneumoniae izolatlarında antibiyotik direnç oranları ve sınıf 1, 2 ve 3 integronların tespiti amaçlanmıştır. Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na Nisan 2023-Temmuz 2023 tarihleri arasında gönderilen farklı klinik örneklerden izole edilmiş 100 Klebsiella pneumoniae izolatı değerlendirmeye alındı. Bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik duyarlılık testleri, Phoenix™ (Becton Dickinson Diagnostics, ABD) otomatize sistemi ile yapıldı. DNA ekstraksiyonunda kaynatma yöntemi kullanıldı. Sınıf 1, 2 ve 3 integrona özgül polimeraz zincir reaksiyonu yapıldı. İzolatların antibiyotik direnç oranları ve sınıf 1, 2 ve 3 integron pozitifliği değerlendirildi. İzolatların 33’ünde (%33) sınıf 1 integron pozitifliği belirlendi. Bir izolatta sınıf 1 ve sınıf 2 integron pozitifliği birlikte tespit edilirken, sınıf 3 integron pozitifliği saptanmadı. İntegron pozitif izolatlar integron negatif izolatlarla karşılaştırıldığında; trimetoprim/sülfametoksazol (p=0.0001), siprofloksasin (p=0.0001), levofloksasin (p=0.01), seftriakson (p=0.05), sefuroksim (p=0.032) ve gentamisin (p=0.006) direnç oranlarında anlamlı direnç yüksekliği saptanmıştır. Ülkemizde integronlar ve ilgili direnç genlerinin araştırıldığı, klinik izolatlarda görülen çoklu antibiyotik direnç mekanizmalarının, antibiyotik direnci ile integron genlerinin ilişkisinin incelendiği kapsamlı çalışmalara ihtiyaç vardır.

查看原文本刊更多论文

调查各种临床样本中肺炎克雷伯菌分离物中的 1、2 和 3 类整合子

整合子/基因盒在促进横向遗传交流方面发挥着重要作用。它们也会导致耐药基因的获得和传播。本研究旨在确定肺炎克雷伯菌分离株的抗生素耐药率和 1、2、3 类整合子。研究评估了 2023 年 4 月至 2023 年 7 月期间从医学微生物实验室送检的不同临床样本中分离出的 100 株肺炎克雷伯菌。细菌鉴定和抗生素药敏试验由 Phoenix™ （美国 Becton Dickinson Diagnostics 公司）自动系统进行。DNA 提取采用煮沸法。进行了 1、2 和 3 级整合素特异性聚合酶链反应。对分离物的抗生素耐药率和 1、2、3 类整合素阳性率进行了评估。有 33 个（33%）分离菌株的 1 类整合素阳性。在一个分离物中同时检测到 1 级和 2 级整合素阳性，但未检测到 3 级整合素阳性。将整合素阳性的分离物与整合素阴性的分离物进行比较，发现对三甲双胍/磺胺甲噁唑（p=0.0001）、环丙沙星（p=0.0001）、左氧氟沙星（p=0.01）、头孢曲松（p=0.05）、头孢呋辛（p=0.032）和庆大霉素（p=0.006）的耐药率显著增加。在我国，需要对整合子和相关耐药基因、临床分离物中出现的多种抗生素耐药机制以及抗生素耐药与整合子基因之间的关系进行全面研究。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

ANKEM dergisi

自引率

0.00%

发文量