Detección molecular de virus en cultivos de uchuva (Physalis peruviana) del suroeste de Antioquia (Colombia)

Erika Corrales-Cabra, Mónica Higuita, Andrea Restrepo, Yuliana Gallo, Pablo Gutiérrez, Mauricio Alejandro Marín Montoya
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Abstract

La uchuva es una de las frutas promisorias para la zona andina de Colombia gracias a su alta demanda internacional. En Antioquia, su siembra se concentra en el oriente, aunque otras subregiones como el norte y suroeste presentan condiciones óptimas para su cultivo. Ya que las enfermedades de origen viral son uno de los problemas emergentes de este frutal, en este estudio se evaluó la infección de virus de RNA que infectan los cultivos de uchuva en el suroeste de Antioquia. Para esto se utilizaron pruebas de RT-qPCR en muestras foliares de plantas sintomáticas y asintomáticas obtenidas en ocho lotes, así como en ocho muestras de semillas extraídas de frutos comercializados en esta subregión. Los resultados indicaron la presencia en al menos una muestra foliar de los virus PVY, PVX, PVS, CGIV-1 y PMTV, mientras que PVV, PYVV y PhyVNV no fueron detectados. El PMTV (75 %) y el PVX (62.5 %) fueron los virus que presentaron mayores niveles de prevalencia en muestras sintomáticas y asintomáticas, respectivamente. Para el caso de las semillas, se encontró la infección de los virus PVX (87.5 %), PVS (75 %), PVY (37.5 %), PhyVNV (12.5 %) y CGIV-1 (12.5 %). Adicionalmente, mediante análisis de NGS se detectó la presencia de secuencias de los virus CMV, PhyVNV, PVS, y TaLMV. Estos hallazgos señalan la necesidad de establecer en el país programas de monitoreo de virus en cultivos de uchuva y de certificación de semilla.
安蒂奥基亚西南部(哥伦比亚)uchuva (Physalis peruviana)培养物病毒的分子检测
由于国际需求旺盛,uchuva是哥伦比亚安第斯地区最有前途的水果之一。在安蒂奥基亚,种植集中在东部,尽管其他次区域,如北部和西南部,有最佳的种植条件。由于病毒性疾病是这种水果出现的问题之一,本研究评估了感染安蒂奥基亚西南部uchuva作物的RNA病毒感染。本研究的目的是评估在巴西南部parana州sao paulo市的一项研究中,对该地区8个批次的有症状和无症状植物的叶片样本以及8个从该次区域销售的水果中提取的种子样本进行RT-qPCR检测。结果表明,至少1个叶片样品中存在PVY、PVX、PVS、CGIV-1和PMTV病毒,而PVV、PYVV和PhyVNV未检测到。在有症状和无症状样本中,PMTV病毒(75%)和PVX病毒(62.5%)的患病率分别较高。种子感染PVX病毒(87.5%)、PVS病毒(75%)、PVY病毒(37.5%)、PhyVNV病毒(12.5%)和CGIV-1病毒(12.5%)。此外,通过NGS分析,检测巨细胞病毒、PhyVNV、PVS和TaLMV的序列。这些发现表明,有必要在该国建立uchuva作物的病毒监测和种子认证项目。
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