Studi Komputasi Aktivitas Senyawa Turunan Santon Sebagai Antikanker Leukemia Myeloid Kronik K562

Indonesian Journal of Mathematics and Natural Sciences Pub Date : 2021-04-12 DOI:10.15294/ijmns.v44i1.32702

Lestari Agustina, K. Kasmui

{"title":"Studi Komputasi Aktivitas Senyawa Turunan Santon Sebagai Antikanker Leukemia Myeloid Kronik K562","authors":"Lestari Agustina, K. Kasmui","doi":"10.15294/ijmns.v44i1.32702","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Analisis hubungan kuantitatif struktur aktivitas (HKSA) terhadap 10 senyawa turunan santon telah dilakukan berdasarkan metode regresi multilinier. Jenis deskriptor yang digunakan adalah deskriptor sterik, deskriptor hidrofobik, dan deskriptor elektronik. Terhadap setiap senyawa dilakukan optimasi geometri dengan metode DFT B3LYP bassis set 6-31G*, kemudian dihitung nilai deskriptornya menggunakan software MarvinBeans dan NWChem. Data aktivitas antikanker IC50 diperoleh dari literatur dan dinyatakan sebagai Log 1/IC50. Data perhitungan deskriptor diolah menggunakan IBM SPSS 21, diperoleh persamaan KHSA sebagai berikut: Log 1/IC50 = 2,759+0,001 Indeks Wiener-8,306 Gap HOMO-LUMO + 0,202Log P + 0,017 PSA + 35,995 LUMO-0,437 Indeks Balaban -0,021 Indeks Harary +0,001Indeks Szeged, dengan n= 10; R=1,00 ; R2=1,00 ; SE= 0; PRESS= 0,00. Dari persamaan HKSA didapatkan prediksi senyawa yang berpotensi sebagai antikanker, yaitu senyawa 6-etoksi-3,4,5,8-tetrahidroksi-2,7-dimetoksi-santon dengan nilai Log 1/IC¬50 4,24588.Quantitative structure activity relationship (QSAR) analysis of 10 xanthone derivatives was carried out based on the multilinier regression method. The types of descriptors used are steric descriptors, hydrophobic descriptors, and electronic descriptors. Geometry optimization is done with each DFT B3LYP bassist set 6-31G * method, then the descriptor values are calculated using MarvinBeans and NWChem software. IC50 anticancer activity data were obtained from literature and stated as Log 1 / IC50. Descriptor calculation data is processed using IBM SPSS 21. Obtained by the QSAR equation as follows: Log 1/IC50 = 2,759+0,001 Indeks Wiener-8,306 Gap HOMO-LUMO + 0,202Log P + 0,017 PSA + 35,995 LUMO-0,437 Indeks Balaban -0,021 Indeks Harary +0,001Indeks Szeged, with n= 10; R=1,00 ; R2=1,00 ; SE= 0; PRESS= 0,00. From the QSAR equation, prediction of potential compounds as anticancer is 6-etoxy-3,4,5,8-tetrahidroxy-2,7-dimetoxy-xhanthone dengan with Log 1/IC50 values 4.245881.","PeriodicalId":412942,"journal":{"name":"Indonesian Journal of Mathematics and Natural Sciences","volume":"14 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-04-12","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Indonesian Journal of Mathematics and Natural Sciences","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.15294/ijmns.v44i1.32702","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

Analisis hubungan kuantitatif struktur aktivitas (HKSA) terhadap 10 senyawa turunan santon telah dilakukan berdasarkan metode regresi multilinier. Jenis deskriptor yang digunakan adalah deskriptor sterik, deskriptor hidrofobik, dan deskriptor elektronik. Terhadap setiap senyawa dilakukan optimasi geometri dengan metode DFT B3LYP bassis set 6-31G*, kemudian dihitung nilai deskriptornya menggunakan software MarvinBeans dan NWChem. Data aktivitas antikanker IC50 diperoleh dari literatur dan dinyatakan sebagai Log 1/IC50. Data perhitungan deskriptor diolah menggunakan IBM SPSS 21, diperoleh persamaan KHSA sebagai berikut: Log 1/IC50 = 2,759+0,001 Indeks Wiener-8,306 Gap HOMO-LUMO + 0,202Log P + 0,017 PSA + 35,995 LUMO-0,437 Indeks Balaban -0,021 Indeks Harary +0,001Indeks Szeged, dengan n= 10; R=1,00 ; R2=1,00 ; SE= 0; PRESS= 0,00. Dari persamaan HKSA didapatkan prediksi senyawa yang berpotensi sebagai antikanker, yaitu senyawa 6-etoksi-3,4,5,8-tetrahidroksi-2,7-dimetoksi-santon dengan nilai Log 1/IC¬50 4,24588.Quantitative structure activity relationship (QSAR) analysis of 10 xanthone derivatives was carried out based on the multilinier regression method. The types of descriptors used are steric descriptors, hydrophobic descriptors, and electronic descriptors. Geometry optimization is done with each DFT B3LYP bassist set 6-31G * method, then the descriptor values are calculated using MarvinBeans and NWChem software. IC50 anticancer activity data were obtained from literature and stated as Log 1 / IC50. Descriptor calculation data is processed using IBM SPSS 21. Obtained by the QSAR equation as follows: Log 1/IC50 = 2,759+0,001 Indeks Wiener-8,306 Gap HOMO-LUMO + 0,202Log P + 0,017 PSA + 35,995 LUMO-0,437 Indeks Balaban -0,021 Indeks Harary +0,001Indeks Szeged, with n= 10; R=1,00 ; R2=1,00 ; SE= 0; PRESS= 0,00. From the QSAR equation, prediction of potential compounds as anticancer is 6-etoxy-3,4,5,8-tetrahidroxy-2,7-dimetoxy-xhanthone dengan with Log 1/IC50 values 4.245881.

查看原文本刊更多论文

研究山顿衍生物作为慢性髓系白血病抗癌的计算活动

对santon衍生物10种化合物的定量结构(HKSA)分析已经采用了一种多线性回归方法。所使用的描述剂类型为sterik描述剂、水力学描述剂和电子描述剂。每一种化合物都通过DFT B3LYP bassis方法6-31G*进行几何优化，然后使用MarvinBeans软件和NWChem来计算它的描画值。反对IC50抗癌活动的数据来自文献，并声明为日志1/IC50。使用IBM SPSS 21进行的描描性计算数据，获得了KHSA方程如下:Log 1/ icsa + 2.759 + 0.001 wienerm + 02306页wienermo + 35,9995 lusa + 35,437 lumoal - 0.021 balaary + 0.021 balance索引R = 1;R2 = 1;SE = 0;PRESS) = 0,00。HKSA得到方程的预测潜在的抗癌作用的化合物,即6-etoksi-3,4,5,8-tetrahidroksi-2,7-dimetoksi-santon化合物和价值1 / IC¬50 4.24588日志。分析10种xanthone衍生物分析基于多线性回归方法。现实生活中的特征是绝育、恐恐症和电子特征。几何上的优化是用6-31G *方法完成的，然后用MarvinBeans和NWChem软件计算出了可分解的价值。IC50 anticancer活动数据来自于日志1 / IC50的文献和陈述。数据描述器正在处理IBM SPSS 21。由QSAR equation as follows编辑部:Log 1/IC50 = 2,759+ 0.001 wienerm - 8306页wienermo + 0.202log P + 0,017 PSA + 35,9995 lumoalR = 1;R2 = 1;SE = 0;PRESS) = 0,00。从QSAR equation中，潜在联合的导引美国反癌症者是6-etoxy- 3,4,8 -四四氢化合物x7 -方法性xhanthone与日志1/IC50 values 4.245881。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

Indonesian Journal of Mathematics and Natural Sciences

自引率

0.00%

发文量