Phylogenetic Analysis of the ORF2 Gene of Human Astrovirus in Guangzhou

Abstract

目的 探讨广州地区儿童感染的星状病毒ORF2基因特点和基因类型.方法参考GenBank上的星状病毒1型ORF2基因设计了两对特异性引物,进行巢式PCR扩增出目标片段,克隆于T载体上,测定序列,用phylip3.65软件、NJ法构建进化树.结果星状病毒ORF2基因为2316bp,编码771个氨基酸,ClustalW同源性比较发现,Hastv-gz克隆与4型星状病毒氨基酸同源性为最高(93%),与其它基因型的同源性为61%～70%.结论广州地区儿童腹泻感染的星状病毒Hastv-gz克隆ORF2基因序列为2316bp,Hastv-gz克隆与4型星状病毒同源性为93%,以phylip3.65软件、NJ法构建ORF2基因进化树中,Hastv-gz与4型星状病毒密切相关,确认Hastv-gz是4型星状病毒。