A IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DA FAMILIA DE GENE 1,3-BETAGLUCOSIDASE DE MANIHOT ESCULENTA CRANTZ

Santos ELIZA DE JESUS BARROS DOS, Lima ALINE MEDEIROS, Santos ADRYANA TRAVASSOS DOS, Paiva RAFAEL DA SILVA
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Abstract

Introdução: A mandioca (Manihot esculenta, Crantz) é uma planta dicotiledônea, arbustiva, de crescimento perene e pertencente à família Euphorbiaceae, na qual tem uma característica de consumo familiar na região norte, e estão distribuídas em várias áreas do meio ambiente, fazendo que os mesmos fiquem expostas a vários fatores, como os estresses bióticos e abióticos. O presente trabalho vem retratar sobre a identificação de caracterização da família de gene 1,3-beta-glucosidase de Manihot Esculenta Crantz. Diante disso, a família de genes glucosidase vem ser importante para retardar o crescimento de fungos patogênicos e diminuir a deterioração dos fungos nos frutos causados pelos mesmo, além disso, a aplicação das glucosidases em controle biológico ocorre devido à composição da parede celular, no qual vem ser a localização subcelular das 1,3-beta-glucosidase nos micro-organismos que são patogênicos. Objetivo: Atrelado a isso, este estudo visa identificar e caracterizar in silico a família de genes 1,3 –beta-glucosidase de Manihot esculenta crantz, através de aspectos evolutivos possibilitando análises de suas atividades enzimáticas e biológicas. Material e métodos: As sequências genômicas dos genes da família de 1,3-beta-glucosidase da mandioca foram obtidas por meio das ferramentas de busca disponível no Phytozome, no qual mostrou 30 sequências genômica que compõe a família glucosidase, onde foram nomeadas de Mesidae1, Mesidae2 .... Mesidae30, entretanto, as 30 sequências estão dispostas em 19 cromossomos. Resultados: Através do programa InterProScan, foi possível analisar que os genes Mesidae2; Mesidae3 e Mesidae10 ambos apresentam 496pb. Já o Mesidae17; Messidae25 e Mesidae30, também irão apresentar uma à similaridade no número de pb, pois vão conter 658. Entretanto, o Mesidae21 e Mesidae28 vão ter 458pb. O Mesidae22 e Mesidae26, irão ter 528pb. Já os Mesidae23 e Mesidae27 vão ter 553 pb, respectivamente todas as sequências vão ter uma variação de 2 a 10 introns na sequência. Através do programa SWISS-MODEL, foi constatado observar o arranjo tridimensional das proteínas. Conclusão: Os resultados obtidos neste trabalho permitem concluir que a família 1,3-beta-glucosidase da Manihot esculenta crantz possui 30 isoformas, onde estas têm as características necessárias para serem consideradas famílias.
木薯1,3- β葡萄糖苷酶基因家族的鉴定和鉴定
简介:木薯((Crantz)是一种灌木dicotiledônea,持续增长和家庭大,有一个特点的北方地区,家庭消费和分布在很多地区的环境,让他们受到压力的各种因素,生物和非生物。本工作描述了木薯1,3- β -葡萄糖苷酶基因家族的鉴定特征。面前的基因家族glucosidase来对人民很重要病原真菌生长和减少损害引起的真菌的水果,此外,glucosidases在生物防治中的应用由于细胞壁的成分,在谁的亚细胞位置1,3β-glucosidase在微生物病原体。目的:与此相关,本研究旨在通过进化方面鉴定和表征木薯1,3 - β -葡萄糖苷酶基因家族,从而分析其酶和生物活性。材料与方法:利用Phytozome中可用的搜索工具获得木薯1,3- β -葡萄糖苷酶家族基因的基因组序列,其中包括30个组成葡萄糖苷酶家族的基因组序列,命名为Mesidae1, Mesidae2…然而,这30个序列排列在19条染色体上。结果:通过InterProScan程序,我们可以分析Mesidae2基因;Mesidae3和Mesidae10均为496pb。已经是月了;弥赛亚25和弥赛亚30在pb的数量上也有相似之处,因为它们将包含658个。然而,Mesidae21和Mesidae28将有458pb。Mesidae22和Mesidae26将有528pb。Mesidae23和Mesidae27将分别有553 bp,所有序列将有2到10个内含子的变化。通过瑞士模型程序,可以观察蛋白质的三维排列。结论:本研究的结果表明,木薯1,3- β -葡萄糖苷酶家族有30个亚型,这些亚型具有被认为是家族的必要特征。
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