生体分子の分子動力学シミュレーション (2) 応用

Abstract

分子動力学シミュレーションは、生体高分子の構造・物性・機能相関の研究に有用であることが一般に認められている。本総説では、筆者らが開発した生体分子解析用ソフトウェアPEACH（Program for Energetic Analysis of bioChemical molecules）を使って、タンパク質とDNAの分子動力学シミュレーションを行う場合の手続きを、実践的に解説する。