Hardware implementation of generalized profile search on the GENSTORM machine

Proceedings. IEEE Symposium on FPGAs for Custom Computing Machines (Cat. No.98TB100251) Pub Date : 1998-04-15 DOI:10.1109/FPGA.1998.707921

E. Mosanya, Jean-Michel Puiatti, E. Sanchez

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Abstract

We describe the hardware implementation of the ProfileScan algorithm, a very sensitive method to discover distant biomolecular sequence relationships. This is part of the GENSTORM project, aimed at providing a dedicated computer for biological sequence processing based on FPGAs.

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GENSTORM机器上广义轮廓搜索的硬件实现

我们描述了ProfileScan算法的硬件实现，这是一种非常敏感的发现远距离生物分子序列关系的方法。这是GENSTORM项目的一部分，旨在为基于fpga的生物序列处理提供专用计算机。

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Proceedings. IEEE Symposium on FPGAs for Custom Computing Machines (Cat. No.98TB100251)

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