Implementation of partially automated calculations on hybrid supercomputers in the modelling of charge transfer in quasi-one-dimensional molecular chains

Abstract

Точность средних зависит от числа реализаций K как K . Для решения таких задач за разумные времена требуются гибридные супер-ЭВМ. При проведении расчетов на кластере в суперкомпьютерном центре коллективного пользования появляются технические проблемы, связанные с политикой администрирования кластера, которые требуют постоянного внимания исследователя. В работе описана частичная автоматизация расчетов на гибридных супер-ЭВМ. Показана эффективность разработанных процедур при моделировании переноса заряда в биополимерах в широком диапазоне температур термостата. Разработанный комплекс программ применяется для серийных расчетов при исследованиях переноса заряда в ДНК на гибридных вычислительных комплексах K-60 и K-100 в ИПМ им. М.В. Келдыша РАН.