Tecnologías ómicas para la exploración de la biocostra del suelo

Jaime Neftalí Márquez-Godoy, Román González-Escobedo
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Abstract

Las tecnologías “ómicas” son herramientas novedosas que facilitan el estudio de las comunidades microbianas de distintos ecosistemas, particularmente de la costra biológica del suelo, también llamada biocostra. Entre estas tecnologías se encuentran la genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica y metagenómica, que son utilizadas para analizar la diversidad y las funciones que llevan a cabo los microorganismos a través del estudio de sus biomoléculas y vías metabólicas. Entre los microorganismos que habitan la biocostra destacan las cianobacterias, las cuales son un grupo de bacterias fototróficas encargadas de realizar procesos importantes en el suelo, tal como la fijación de nitrógeno atmosférico, carbono orgánico, síntesis de clorofila y ficobilinas, así como la producción de exopolisacáridos para mejorar la estabilidad y fertilidad del suelo. Por lo tanto, el objetivo de la presente revisión es el de explorar la diversidad y la función que desempeñan estas comunidades microbianas en la biocostra, particularmente las cianobacterias, destacando los estudios realizados mediante el uso de las tecnologías ómicas. El conocimiento generado en los últimos años a través de las tecnologías ómicas ha demostrado la limitada cobertura que presentan las técnicas moleculares tradicionales, resultando en una subestimación de la diversidad real de las comunidades microbianas. Además, se ha mejorado la comprensión de los procesos ecológicos desarrollados por los microorganismos en beneficio de la biocostra, así como las capacidades funcionales individuales y colectivas, las cuales servirán como línea base para proponer estrategias importantes que solucionen la problemática de la degradación de los suelos.
土壤生物壳勘探的组学技术
“组学”技术是一种新颖的工具,有助于研究不同生态系统的微生物群落,特别是生物土壤外壳,也称为生物外壳。这些技术包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和宏基因组学,它们通过研究微生物的生物分子和代谢途径来分析微生物的多样性和功能。生活的biocostra微生物包括蓝藻菌,是一群细菌fototróficas负责进行重要工作在地板上,比如固定大气、有机碳、氮合成叶绿素ficobilinas,以及生产的方法,以改善稳定和土壤肥力。因此,本综述的目的是探索生物壳中这些微生物群落的多样性和作用,特别是蓝藻,强调使用组学技术进行的研究。近年来通过组学技术产生的知识表明,传统分子技术的覆盖范围有限,导致低估了微生物群落的真实多样性。此外,为了生物壳的利益,对微生物发展的生态过程以及个人和集体功能能力的理解也得到了提高,这将作为提出解决土壤退化问题的重要战略的基线。
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