{"title":"IDENTIFICATION AND DISTRIBUTION OF THE HH4 FERTILITY HAPLOTYPE OF HOLSTEIN CATTLE IN A SUBPOPULATION OF THE KRASNODAR TERRITORY","authors":"Н.В. Ковалюк, А.Е. Волченко, Е.В. Ширяева, Л.И. Якушева, Ю.Ю. Шахназарова","doi":"10.33943/mms.2023.72.97.003","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Мутация, связанная с гаплотипом HH4, приводит к замене аденина (A) на цитозин (C) в положении 1277227 (g.1277227A>C) на хромосоме BTA1, что вызывает замену аспарагина на треонин в одном из белков (GART), необходимых для биосинтеза таких важных молекул, как ДНК, РНК, АТФ. Потеря функции GART вызывает гибель эмбрионов на самых ранних стадиях после оплодотворения. Нами разработана тест-система для идентификации животных — носителей гаплотипа НН4 — на основе методов ПЦР/ПДРФ. В статье приведены последовательности праймеров, условия ПЦР-реакции, указаны необходимая эндонуклеаза и условия рестрикции. С использованием контрольного образца проведены апробация разработанной тест-системы и генотипирование выборки (n=130) образцов крови коров и телок из 3 хозяйств Краснодарского края и спермы быков-производителей, принадлежащих двум племенным предприятиям. Установлено, что частота встречаемости носителей гаплотипа в протестированной выборке животных (2023 год) составила 1,5%.\n The mutation associated with the haplotype HH4 leads to the replacement of adenine (A) with cytosine (C) at position 1277227 (g.1277227A>C) on the BTA1 chromosome, which causes the replacement of asparagine with threonine in one of the proteins (GART) necessary for the biosynthesis of such important molecules as DNA, RNA, ATF. Loss of GART function causes the death of embryos at the earliest stages after fertilization. We have developed a test system for the identification of haplotype HH4 carrier animals based on PCR/PDRF methods. The article presents the sequences of primers, the conditions of the PCR reaction, the necessary endonuclease and restriction conditions. With the use of a control sample, the developed test system was tested and a sample (n=130) of blood samples of cows and heifers from 3 farms of the Krasnodar Territory and sperm of bulls belonging to two breeding enterprises was genotyped. It was found that the frequency of occurrence of haplotype carriers in the tested sample of animals was 1.5%.","PeriodicalId":301520,"journal":{"name":"Molochnoe i miasnoe skotovodstvo","volume":"53 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-08-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Molochnoe i miasnoe skotovodstvo","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.33943/mms.2023.72.97.003","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Abstract
Мутация, связанная с гаплотипом HH4, приводит к замене аденина (A) на цитозин (C) в положении 1277227 (g.1277227A>C) на хромосоме BTA1, что вызывает замену аспарагина на треонин в одном из белков (GART), необходимых для биосинтеза таких важных молекул, как ДНК, РНК, АТФ. Потеря функции GART вызывает гибель эмбрионов на самых ранних стадиях после оплодотворения. Нами разработана тест-система для идентификации животных — носителей гаплотипа НН4 — на основе методов ПЦР/ПДРФ. В статье приведены последовательности праймеров, условия ПЦР-реакции, указаны необходимая эндонуклеаза и условия рестрикции. С использованием контрольного образца проведены апробация разработанной тест-системы и генотипирование выборки (n=130) образцов крови коров и телок из 3 хозяйств Краснодарского края и спермы быков-производителей, принадлежащих двум племенным предприятиям. Установлено, что частота встречаемости носителей гаплотипа в протестированной выборке животных (2023 год) составила 1,5%.
The mutation associated with the haplotype HH4 leads to the replacement of adenine (A) with cytosine (C) at position 1277227 (g.1277227A>C) on the BTA1 chromosome, which causes the replacement of asparagine with threonine in one of the proteins (GART) necessary for the biosynthesis of such important molecules as DNA, RNA, ATF. Loss of GART function causes the death of embryos at the earliest stages after fertilization. We have developed a test system for the identification of haplotype HH4 carrier animals based on PCR/PDRF methods. The article presents the sequences of primers, the conditions of the PCR reaction, the necessary endonuclease and restriction conditions. With the use of a control sample, the developed test system was tested and a sample (n=130) of blood samples of cows and heifers from 3 farms of the Krasnodar Territory and sperm of bulls belonging to two breeding enterprises was genotyped. It was found that the frequency of occurrence of haplotype carriers in the tested sample of animals was 1.5%.
HH4导致替换突变相关单倍体腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)规定在染色体BTA1 1277227 (g.1277227A > C)之一,导致аспарагин换成треонин如此重要的生物合成所需的蛋白(GART)像dna, rna分子atp。GART功能的丧失导致受精后早期胚胎死亡。我们开发了一个测试系统,根据pcr / pdrf方法来识别n4单倍体动物。本文列出了初选序列、pcr反应条件、必要的内核条件和修剪条件。使用控制样本,对开发的测试系统进行了测试,并对来自krasnodar 3个农场的奶牛和母牛样本进行了抽样(n=130),并对属于两个部落企业的奶牛生产精子进行了抽样。据估计,在2023年的动物测试样本中,单倍型载体的频率为1.5%。The突变(associated with The haplotype HH4件事to The替换of adenine (A)和(C) at with cytosine摆好姿势1277227 (g.1277227A > C) on The BTA1 chromosome,即将到来的主演替换of asparagine with threonine in one of The necessary for The biosynthesis proteins (GART)副本的ATF important分子as DNA, RNA。失去了GART function causes在earlist stages的死亡。我们有一个开发测试系统来识别PCR/PDRF methods。第一人称牧师,第一人称牧师,第二人称牧师,第二人称牧师。有了控制sample,开发测试系统是测试和测试,从3个血萨姆和黑鬼从3个血萨姆和公牛的血池到2个血源。这是动物训练训练有素的骑手在1.5%的时间里所做的。