Avaliação da aplicação de paralelismo em classificadores taxonômicos usando Qiime2

Caetano Müller, Júnior Löff, Dalvan Griebler, Eduardo Eizirik
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Abstract

A classificação de sequências de DNA usando algoritmos de aprendizado de máquina ainda tem espaço para evoluir, tanto na qualidade do resultado quanto na eficiência computacional dos algoritmos. Nesse trabalho, realizou-se uma avaliação de desempenho em dois algoritmos de aprendizado de máquina da ferramenta Qiime2 para classificação de sequências de DNA. Os resultados mostram que o desempenho melhorou em até 9,65 vezes utilizando 9 threads.
利用Qiime2对分类法并行性应用的评价
使用机器学习算法对DNA序列进行分类仍有发展的空间,无论是在结果质量上还是在算法的计算效率上。在这项工作中,我们对Qiime2工具的两种机器学习算法进行了性能评估,用于DNA序列分类。结果表明,使用9个线程,性能提高了9.65倍。
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