Nature｜转座元件ISL3驱动屎肠球菌快速适应，破解医院致病菌进化新机制

本研究针对医院感染致病菌屎肠球菌的快速适应机制进行了系统性解析。背景方面，医院感染病原体面临极端选择压力，传统观点认为单核苷酸变异等是主要驱动因素，但插入序列的作用未被充分阐明。研究目的旨在揭示转座元件如何驱动屎肠球菌在临床环境中的快速适应性进化。通过对19485株高完整度ESKAPEE病原基因组、109株临床菌株长读长测序及12例造血干细胞移植患者纵向宏基因组分析，研究发现ISL3家族插入序列是核心驱动元件，医院相关A1枝菌株平均含35.2个ISL3拷贝。结论证实ISL3通过携带外向启动子调控基因表达，例如插入叶酸转运蛋白基因folT上游增强代谢能力，且该变异在全球菌株中反复出现，并被正向选择。研究指出，CRISPR-Cas等防御系统缺失为ISL3扩增提供条件，推动屎肠球菌从共生菌向医院致病菌演化。该发现彻底改写了细菌医院适应性进化认知，为多重耐药菌防控提供了新靶点。