华中农业大学博士生第一作者在顶级期刊发表研究成果，取得菌群构建机制研究新进展

本研究背景为食性是影响宿主与肠道微生物共生关系的核心生态因子，但具体影响机制尚待阐明。研究目的旨在系统探究不同食性如何驱动淡水鱼肠道微生物的群落组装、生态网络重构及共生菌的适应性进化。研究选取了五种代表性食性的中国主要养殖淡水鱼，综合运用宏基因组学、靶向培养、比较基因组学和体外实验。结论表明，食性生态位对肠道微生物群落产生强烈的“确定性”效应，不同食性鱼类肠道菌群在生态网络拓扑结构上显著差异。鲸杆菌属被鉴定为核心共生菌，在杂食性鱼类中相对丰度更高，并表现出基因组精简化和保守化进化。研究成功分离出多株鲸杆菌菌株，建立了从群落模式到可培养资源的“生态-进化”关联，为水产养殖微生物调控提供了理论框架。